Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nlrx1Q3TL44 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Nlrx1Q3TL44 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nlrx1Q3TL44 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nlrx1Q3TL44 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nlrx1Q3TL44 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nlrx1Q3TL44 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nlrx1Q3TL44 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nlrx1Q3TL44 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nlrx1Q3TL44 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nlrx1Q3TL44 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nlrx1Q3TL44 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nlrx1Q3TL44 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nlrx1Q3TL44 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nlrx1Q3TL44 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nlrx1Q3TL44 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nlrx1Q3TL44 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Nlrx1Q3TL44 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nlrx1Q3TL44 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Nlrx1Q3TL44 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nlrx1Q3TL44 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nlrx1Q3TL44 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nlrx1Q3TL44 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nlrx1Q3TL44 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nlrx1Q3TL44 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nlrx1Q3TL44 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nlrx1Q3TL44 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nlrx1Q3TL44 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nlrx1Q3TL44 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nlrx1Q3TL44 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nlrx1Q3TL44 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nlrx1Q3TL44 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nlrx1Q3TL44 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nlrx1Q3TL44 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nlrx1Q3TL44 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nlrx1Q3TL44 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nlrx1Q3TL44 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nlrx1Q3TL44 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nlrx1Q3TL44 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nlrx1Q3TL44 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nlrx1Q3TL44 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nlrx1Q3TL44 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nlrx1Q3TL44 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nlrx1Q3TL44 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nlrx1Q3TL44 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nlrx1Q3TL44 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nlrx1Q3TL44 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nlrx1Q3TL44 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nlrx1Q3TL44 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nlrx1Q3TL44 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nlrx1Q3TL44 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nlrx1Q3TL44 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nlrx1Q3TL44 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nlrx1Q3TL44 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nlrx1Q3TL44 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Nlrx1Q3TL44 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nlrx1Q3TL44 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nlrx1Q3TL44 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nlrx1Q3TL44 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Nlrx1Q3TL44 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nlrx1Q3TL44 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nlrx1Q3TL44 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nlrx1Q3TL44 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nlrx1Q3TL44 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nlrx1Q3TL44 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nlrx1Q3TL44 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nlrx1Q3TL44 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nlrx1Q3TL44 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nlrx1Q3TL44 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nlrx1Q3TL44 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nlrx1Q3TL44 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nlrx1Q3TL44 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nlrx1Q3TL44 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nlrx1Q3TL44 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nlrx1Q3TL44 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nlrx1Q3TL44 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nlrx1Q3TL44 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nlrx1Q3TL44 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nlrx1Q3TL44 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nlrx1Q3TL44 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nlrx1Q3TL44 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Nlrx1Q3TL44 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nlrx1Q3TL44 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nlrx1Q3TL44 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nlrx1Q3TL44 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nlrx1Q3TL44 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Nlrx1Q3TL44 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nlrx1Q3TL44 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nlrx1Q3TL44 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nlrx1Q3TL44 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nlrx1Q3TL44 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nlrx1Q3TL44 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nlrx1Q3TL44 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nlrx1Q3TL44 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nlrx1Q3TL44 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Nlrx1Q3TL44 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nlrx1Q3TL44 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nlrx1Q3TL44 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nlrx1Q3TL44 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nlrx1Q3TL44 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.2 ms