Protein–RNA interactions for Protein: Q2KN98

Specc1l, Cytospin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1lQ2KN98 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Specc1lQ2KN98 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Specc1lQ2KN98 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Specc1lQ2KN98 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Specc1lQ2KN98 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Specc1lQ2KN98 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Specc1lQ2KN98 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Specc1lQ2KN98 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Specc1lQ2KN98 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Specc1lQ2KN98 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Specc1lQ2KN98 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Specc1lQ2KN98 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Specc1lQ2KN98 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Specc1lQ2KN98 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Specc1lQ2KN98 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Specc1lQ2KN98 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Specc1lQ2KN98 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Specc1lQ2KN98 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Specc1lQ2KN98 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Specc1lQ2KN98 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Specc1lQ2KN98 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Specc1lQ2KN98 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Specc1lQ2KN98 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Specc1lQ2KN98 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Specc1lQ2KN98 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Specc1lQ2KN98 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Specc1lQ2KN98 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Specc1lQ2KN98 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Specc1lQ2KN98 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Specc1lQ2KN98 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Specc1lQ2KN98 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Specc1lQ2KN98 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Specc1lQ2KN98 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Specc1lQ2KN98 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Specc1lQ2KN98 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Specc1lQ2KN98 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Specc1lQ2KN98 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Specc1lQ2KN98 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Specc1lQ2KN98 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Specc1lQ2KN98 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Specc1lQ2KN98 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Specc1lQ2KN98 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Specc1lQ2KN98 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Specc1lQ2KN98 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Specc1lQ2KN98 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Specc1lQ2KN98 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Specc1lQ2KN98 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Specc1lQ2KN98 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Specc1lQ2KN98 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Specc1lQ2KN98 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Specc1lQ2KN98 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Specc1lQ2KN98 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Specc1lQ2KN98 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Specc1lQ2KN98 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Specc1lQ2KN98 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Specc1lQ2KN98 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Specc1lQ2KN98 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Specc1lQ2KN98 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Specc1lQ2KN98 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Specc1lQ2KN98 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Specc1lQ2KN98 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Specc1lQ2KN98 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Specc1lQ2KN98 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Specc1lQ2KN98 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Specc1lQ2KN98 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Specc1lQ2KN98 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Specc1lQ2KN98 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Specc1lQ2KN98 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Specc1lQ2KN98 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Specc1lQ2KN98 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Specc1lQ2KN98 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Specc1lQ2KN98 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Specc1lQ2KN98 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Specc1lQ2KN98 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Specc1lQ2KN98 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Specc1lQ2KN98 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Specc1lQ2KN98 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Specc1lQ2KN98 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Specc1lQ2KN98 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Specc1lQ2KN98 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Specc1lQ2KN98 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Specc1lQ2KN98 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Specc1lQ2KN98 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Specc1lQ2KN98 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Specc1lQ2KN98 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Specc1lQ2KN98 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Specc1lQ2KN98 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Specc1lQ2KN98 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Specc1lQ2KN98 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Specc1lQ2KN98 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Specc1lQ2KN98 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Specc1lQ2KN98 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Specc1lQ2KN98 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Specc1lQ2KN98 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Specc1lQ2KN98 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Specc1lQ2KN98 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Specc1lQ2KN98 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Specc1lQ2KN98 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Specc1lQ2KN98 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Specc1lQ2KN98 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms