Protein–RNA interactions for Protein: Q2HXL6

Edem3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edem3Q2HXL6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Edem3Q2HXL6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Edem3Q2HXL6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Edem3Q2HXL6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Edem3Q2HXL6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Edem3Q2HXL6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Edem3Q2HXL6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Edem3Q2HXL6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Edem3Q2HXL6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Edem3Q2HXL6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Edem3Q2HXL6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Edem3Q2HXL6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Edem3Q2HXL6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Edem3Q2HXL6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Edem3Q2HXL6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Edem3Q2HXL6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Edem3Q2HXL6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Edem3Q2HXL6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Edem3Q2HXL6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Edem3Q2HXL6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Edem3Q2HXL6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Edem3Q2HXL6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Edem3Q2HXL6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Edem3Q2HXL6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Edem3Q2HXL6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Edem3Q2HXL6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Edem3Q2HXL6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Edem3Q2HXL6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Edem3Q2HXL6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Edem3Q2HXL6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Edem3Q2HXL6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Edem3Q2HXL6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Edem3Q2HXL6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Edem3Q2HXL6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Edem3Q2HXL6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Edem3Q2HXL6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Edem3Q2HXL6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Edem3Q2HXL6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Edem3Q2HXL6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Edem3Q2HXL6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Edem3Q2HXL6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Edem3Q2HXL6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Edem3Q2HXL6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Edem3Q2HXL6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Edem3Q2HXL6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Edem3Q2HXL6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Edem3Q2HXL6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Edem3Q2HXL6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Edem3Q2HXL6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Edem3Q2HXL6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Edem3Q2HXL6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Edem3Q2HXL6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Edem3Q2HXL6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Edem3Q2HXL6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Edem3Q2HXL6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Edem3Q2HXL6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Edem3Q2HXL6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Edem3Q2HXL6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Edem3Q2HXL6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Edem3Q2HXL6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Edem3Q2HXL6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Edem3Q2HXL6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Edem3Q2HXL6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Edem3Q2HXL6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Edem3Q2HXL6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Edem3Q2HXL6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Edem3Q2HXL6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Edem3Q2HXL6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Edem3Q2HXL6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Edem3Q2HXL6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Edem3Q2HXL6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Edem3Q2HXL6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Edem3Q2HXL6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Edem3Q2HXL6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Edem3Q2HXL6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Edem3Q2HXL6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Edem3Q2HXL6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Edem3Q2HXL6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Edem3Q2HXL6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Edem3Q2HXL6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Edem3Q2HXL6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Edem3Q2HXL6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Edem3Q2HXL6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Edem3Q2HXL6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Edem3Q2HXL6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Edem3Q2HXL6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Edem3Q2HXL6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Edem3Q2HXL6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Edem3Q2HXL6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Edem3Q2HXL6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Edem3Q2HXL6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Edem3Q2HXL6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Edem3Q2HXL6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Edem3Q2HXL6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Edem3Q2HXL6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Edem3Q2HXL6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Edem3Q2HXL6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Edem3Q2HXL6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Edem3Q2HXL6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Edem3Q2HXL6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms