Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cpne7Q0VE82 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cpne7Q0VE82 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cpne7Q0VE82 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Cpne7Q0VE82 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cpne7Q0VE82 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Cpne7Q0VE82 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cpne7Q0VE82 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cpne7Q0VE82 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cpne7Q0VE82 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cpne7Q0VE82 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cpne7Q0VE82 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cpne7Q0VE82 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cpne7Q0VE82 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cpne7Q0VE82 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cpne7Q0VE82 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cpne7Q0VE82 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cpne7Q0VE82 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cpne7Q0VE82 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cpne7Q0VE82 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cpne7Q0VE82 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cpne7Q0VE82 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cpne7Q0VE82 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cpne7Q0VE82 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cpne7Q0VE82 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cpne7Q0VE82 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cpne7Q0VE82 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cpne7Q0VE82 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cpne7Q0VE82 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cpne7Q0VE82 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cpne7Q0VE82 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cpne7Q0VE82 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cpne7Q0VE82 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cpne7Q0VE82 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cpne7Q0VE82 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cpne7Q0VE82 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cpne7Q0VE82 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cpne7Q0VE82 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cpne7Q0VE82 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cpne7Q0VE82 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cpne7Q0VE82 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Cpne7Q0VE82 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cpne7Q0VE82 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cpne7Q0VE82 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cpne7Q0VE82 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cpne7Q0VE82 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Cpne7Q0VE82 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cpne7Q0VE82 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cpne7Q0VE82 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cpne7Q0VE82 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cpne7Q0VE82 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Cpne7Q0VE82 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cpne7Q0VE82 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cpne7Q0VE82 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cpne7Q0VE82 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cpne7Q0VE82 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cpne7Q0VE82 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cpne7Q0VE82 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cpne7Q0VE82 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cpne7Q0VE82 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cpne7Q0VE82 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cpne7Q0VE82 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cpne7Q0VE82 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cpne7Q0VE82 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cpne7Q0VE82 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cpne7Q0VE82 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cpne7Q0VE82 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cpne7Q0VE82 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cpne7Q0VE82 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cpne7Q0VE82 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Cpne7Q0VE82 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Cpne7Q0VE82 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cpne7Q0VE82 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cpne7Q0VE82 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cpne7Q0VE82 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cpne7Q0VE82 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cpne7Q0VE82 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cpne7Q0VE82 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cpne7Q0VE82 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cpne7Q0VE82 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cpne7Q0VE82 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cpne7Q0VE82 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cpne7Q0VE82 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cpne7Q0VE82 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cpne7Q0VE82 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cpne7Q0VE82 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cpne7Q0VE82 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cpne7Q0VE82 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cpne7Q0VE82 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cpne7Q0VE82 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cpne7Q0VE82 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Cpne7Q0VE82 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cpne7Q0VE82 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cpne7Q0VE82 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cpne7Q0VE82 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cpne7Q0VE82 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cpne7Q0VE82 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cpne7Q0VE82 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cpne7Q0VE82 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cpne7Q0VE82 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms