Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Samd12Q0VE29 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Samd12Q0VE29 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Samd12Q0VE29 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Samd12Q0VE29 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Samd12Q0VE29 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samd12Q0VE29 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samd12Q0VE29 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samd12Q0VE29 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Samd12Q0VE29 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Samd12Q0VE29 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Samd12Q0VE29 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Samd12Q0VE29 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samd12Q0VE29 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samd12Q0VE29 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samd12Q0VE29 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samd12Q0VE29 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samd12Q0VE29 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samd12Q0VE29 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samd12Q0VE29 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Samd12Q0VE29 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Samd12Q0VE29 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samd12Q0VE29 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Samd12Q0VE29 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samd12Q0VE29 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samd12Q0VE29 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samd12Q0VE29 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samd12Q0VE29 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samd12Q0VE29 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samd12Q0VE29 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samd12Q0VE29 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samd12Q0VE29 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samd12Q0VE29 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samd12Q0VE29 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samd12Q0VE29 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd12Q0VE29 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd12Q0VE29 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samd12Q0VE29 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samd12Q0VE29 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samd12Q0VE29 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samd12Q0VE29 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samd12Q0VE29 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samd12Q0VE29 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samd12Q0VE29 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Samd12Q0VE29 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samd12Q0VE29 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samd12Q0VE29 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samd12Q0VE29 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Samd12Q0VE29 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Samd12Q0VE29 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Samd12Q0VE29 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samd12Q0VE29 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd12Q0VE29 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samd12Q0VE29 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Samd12Q0VE29 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samd12Q0VE29 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samd12Q0VE29 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samd12Q0VE29 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samd12Q0VE29 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samd12Q0VE29 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samd12Q0VE29 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samd12Q0VE29 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samd12Q0VE29 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samd12Q0VE29 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Samd12Q0VE29 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Samd12Q0VE29 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Samd12Q0VE29 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Samd12Q0VE29 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Samd12Q0VE29 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Samd12Q0VE29 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Samd12Q0VE29 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samd12Q0VE29 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samd12Q0VE29 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samd12Q0VE29 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samd12Q0VE29 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samd12Q0VE29 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Samd12Q0VE29 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Samd12Q0VE29 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Samd12Q0VE29 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Samd12Q0VE29 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samd12Q0VE29 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samd12Q0VE29 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samd12Q0VE29 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samd12Q0VE29 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samd12Q0VE29 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samd12Q0VE29 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samd12Q0VE29 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samd12Q0VE29 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samd12Q0VE29 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Samd12Q0VE29 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samd12Q0VE29 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd12Q0VE29 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd12Q0VE29 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samd12Q0VE29 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samd12Q0VE29 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samd12Q0VE29 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Samd12Q0VE29 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samd12Q0VE29 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samd12Q0VE29 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samd12Q0VE29 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms