Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T9

Cntnap5a, Contactin-associated protein like 5-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5aQ0V8T9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cntnap5aQ0V8T9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cntnap5aQ0V8T9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cntnap5aQ0V8T9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cntnap5aQ0V8T9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cntnap5aQ0V8T9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cntnap5aQ0V8T9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cntnap5aQ0V8T9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cntnap5aQ0V8T9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cntnap5aQ0V8T9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cntnap5aQ0V8T9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cntnap5aQ0V8T9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cntnap5aQ0V8T9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cntnap5aQ0V8T9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cntnap5aQ0V8T9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cntnap5aQ0V8T9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Cntnap5aQ0V8T9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cntnap5aQ0V8T9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cntnap5aQ0V8T9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cntnap5aQ0V8T9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cntnap5aQ0V8T9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cntnap5aQ0V8T9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cntnap5aQ0V8T9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cntnap5aQ0V8T9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cntnap5aQ0V8T9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cntnap5aQ0V8T9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cntnap5aQ0V8T9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cntnap5aQ0V8T9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cntnap5aQ0V8T9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cntnap5aQ0V8T9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cntnap5aQ0V8T9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cntnap5aQ0V8T9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cntnap5aQ0V8T9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cntnap5aQ0V8T9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cntnap5aQ0V8T9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cntnap5aQ0V8T9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cntnap5aQ0V8T9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cntnap5aQ0V8T9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cntnap5aQ0V8T9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cntnap5aQ0V8T9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cntnap5aQ0V8T9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cntnap5aQ0V8T9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cntnap5aQ0V8T9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cntnap5aQ0V8T9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cntnap5aQ0V8T9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cntnap5aQ0V8T9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Cntnap5aQ0V8T9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cntnap5aQ0V8T9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cntnap5aQ0V8T9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cntnap5aQ0V8T9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cntnap5aQ0V8T9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cntnap5aQ0V8T9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cntnap5aQ0V8T9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cntnap5aQ0V8T9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cntnap5aQ0V8T9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cntnap5aQ0V8T9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cntnap5aQ0V8T9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cntnap5aQ0V8T9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cntnap5aQ0V8T9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cntnap5aQ0V8T9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cntnap5aQ0V8T9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cntnap5aQ0V8T9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Cntnap5aQ0V8T9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Cntnap5aQ0V8T9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cntnap5aQ0V8T9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cntnap5aQ0V8T9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cntnap5aQ0V8T9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cntnap5aQ0V8T9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cntnap5aQ0V8T9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Cntnap5aQ0V8T9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cntnap5aQ0V8T9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cntnap5aQ0V8T9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cntnap5aQ0V8T9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cntnap5aQ0V8T9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cntnap5aQ0V8T9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cntnap5aQ0V8T9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cntnap5aQ0V8T9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cntnap5aQ0V8T9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cntnap5aQ0V8T9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cntnap5aQ0V8T9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cntnap5aQ0V8T9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cntnap5aQ0V8T9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cntnap5aQ0V8T9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cntnap5aQ0V8T9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Cntnap5aQ0V8T9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cntnap5aQ0V8T9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cntnap5aQ0V8T9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cntnap5aQ0V8T9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Cntnap5aQ0V8T9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cntnap5aQ0V8T9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cntnap5aQ0V8T9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cntnap5aQ0V8T9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cntnap5aQ0V8T9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cntnap5aQ0V8T9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cntnap5aQ0V8T9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cntnap5aQ0V8T9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cntnap5aQ0V8T9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cntnap5aQ0V8T9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cntnap5aQ0V8T9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms