Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cass4Q08EC4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cass4Q08EC4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cass4Q08EC4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cass4Q08EC4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cass4Q08EC4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cass4Q08EC4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cass4Q08EC4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cass4Q08EC4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cass4Q08EC4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cass4Q08EC4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cass4Q08EC4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cass4Q08EC4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cass4Q08EC4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cass4Q08EC4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cass4Q08EC4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cass4Q08EC4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cass4Q08EC4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cass4Q08EC4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cass4Q08EC4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cass4Q08EC4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cass4Q08EC4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Cass4Q08EC4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cass4Q08EC4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cass4Q08EC4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cass4Q08EC4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cass4Q08EC4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cass4Q08EC4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cass4Q08EC4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cass4Q08EC4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cass4Q08EC4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cass4Q08EC4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cass4Q08EC4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cass4Q08EC4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cass4Q08EC4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cass4Q08EC4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cass4Q08EC4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cass4Q08EC4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cass4Q08EC4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cass4Q08EC4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cass4Q08EC4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cass4Q08EC4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cass4Q08EC4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cass4Q08EC4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cass4Q08EC4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cass4Q08EC4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cass4Q08EC4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cass4Q08EC4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cass4Q08EC4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cass4Q08EC4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cass4Q08EC4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cass4Q08EC4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cass4Q08EC4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cass4Q08EC4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cass4Q08EC4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cass4Q08EC4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cass4Q08EC4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cass4Q08EC4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cass4Q08EC4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cass4Q08EC4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cass4Q08EC4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cass4Q08EC4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cass4Q08EC4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cass4Q08EC4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cass4Q08EC4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cass4Q08EC4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cass4Q08EC4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cass4Q08EC4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cass4Q08EC4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cass4Q08EC4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cass4Q08EC4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cass4Q08EC4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cass4Q08EC4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cass4Q08EC4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cass4Q08EC4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cass4Q08EC4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cass4Q08EC4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cass4Q08EC4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cass4Q08EC4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cass4Q08EC4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cass4Q08EC4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cass4Q08EC4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cass4Q08EC4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cass4Q08EC4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cass4Q08EC4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cass4Q08EC4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cass4Q08EC4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cass4Q08EC4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cass4Q08EC4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cass4Q08EC4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cass4Q08EC4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cass4Q08EC4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cass4Q08EC4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cass4Q08EC4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cass4Q08EC4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cass4Q08EC4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cass4Q08EC4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cass4Q08EC4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cass4Q08EC4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cass4Q08EC4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms