Protein–RNA interactions for Protein: Q08639

Tfdp1, Transcription factor Dp-1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfdp1Q08639 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tfdp1Q08639 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tfdp1Q08639 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tfdp1Q08639 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tfdp1Q08639 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tfdp1Q08639 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tfdp1Q08639 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tfdp1Q08639 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tfdp1Q08639 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tfdp1Q08639 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tfdp1Q08639 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tfdp1Q08639 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Tfdp1Q08639 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tfdp1Q08639 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tfdp1Q08639 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tfdp1Q08639 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tfdp1Q08639 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Tfdp1Q08639 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tfdp1Q08639 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tfdp1Q08639 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tfdp1Q08639 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tfdp1Q08639 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tfdp1Q08639 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tfdp1Q08639 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tfdp1Q08639 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tfdp1Q08639 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tfdp1Q08639 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tfdp1Q08639 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tfdp1Q08639 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tfdp1Q08639 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Tfdp1Q08639 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tfdp1Q08639 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tfdp1Q08639 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tfdp1Q08639 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tfdp1Q08639 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tfdp1Q08639 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tfdp1Q08639 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tfdp1Q08639 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tfdp1Q08639 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tfdp1Q08639 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tfdp1Q08639 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tfdp1Q08639 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tfdp1Q08639 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tfdp1Q08639 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tfdp1Q08639 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tfdp1Q08639 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tfdp1Q08639 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tfdp1Q08639 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Tfdp1Q08639 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Tfdp1Q08639 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tfdp1Q08639 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tfdp1Q08639 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tfdp1Q08639 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tfdp1Q08639 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tfdp1Q08639 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tfdp1Q08639 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tfdp1Q08639 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tfdp1Q08639 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tfdp1Q08639 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tfdp1Q08639 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tfdp1Q08639 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Tfdp1Q08639 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tfdp1Q08639 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tfdp1Q08639 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tfdp1Q08639 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tfdp1Q08639 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tfdp1Q08639 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tfdp1Q08639 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Tfdp1Q08639 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tfdp1Q08639 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tfdp1Q08639 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tfdp1Q08639 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tfdp1Q08639 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tfdp1Q08639 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Tfdp1Q08639 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tfdp1Q08639 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tfdp1Q08639 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tfdp1Q08639 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tfdp1Q08639 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tfdp1Q08639 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tfdp1Q08639 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tfdp1Q08639 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Tfdp1Q08639 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tfdp1Q08639 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tfdp1Q08639 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tfdp1Q08639 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tfdp1Q08639 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tfdp1Q08639 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tfdp1Q08639 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tfdp1Q08639 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tfdp1Q08639 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tfdp1Q08639 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tfdp1Q08639 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tfdp1Q08639 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tfdp1Q08639 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tfdp1Q08639 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tfdp1Q08639 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tfdp1Q08639 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tfdp1Q08639 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tfdp1Q08639 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms