Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
F13bQ07968 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
F13bQ07968 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
F13bQ07968 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
F13bQ07968 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
F13bQ07968 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
F13bQ07968 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
F13bQ07968 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
F13bQ07968 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
F13bQ07968 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
F13bQ07968 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
F13bQ07968 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
F13bQ07968 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
F13bQ07968 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
F13bQ07968 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
F13bQ07968 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
F13bQ07968 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
F13bQ07968 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
F13bQ07968 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
F13bQ07968 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
F13bQ07968 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
F13bQ07968 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
F13bQ07968 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
F13bQ07968 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
F13bQ07968 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
F13bQ07968 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
F13bQ07968 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
F13bQ07968 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
F13bQ07968 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
F13bQ07968 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
F13bQ07968 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
F13bQ07968 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
F13bQ07968 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
F13bQ07968 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
F13bQ07968 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
F13bQ07968 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
F13bQ07968 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
F13bQ07968 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
F13bQ07968 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
F13bQ07968 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
F13bQ07968 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
F13bQ07968 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
F13bQ07968 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
F13bQ07968 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
F13bQ07968 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
F13bQ07968 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
F13bQ07968 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
F13bQ07968 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
F13bQ07968 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
F13bQ07968 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
F13bQ07968 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
F13bQ07968 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
F13bQ07968 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
F13bQ07968 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F13bQ07968 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.28■■□□□ 1
F13bQ07968 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
F13bQ07968 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
F13bQ07968 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
F13bQ07968 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
F13bQ07968 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
F13bQ07968 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
F13bQ07968 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
F13bQ07968 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
F13bQ07968 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
F13bQ07968 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
F13bQ07968 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
F13bQ07968 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
F13bQ07968 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
F13bQ07968 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
F13bQ07968 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
F13bQ07968 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
F13bQ07968 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
F13bQ07968 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
F13bQ07968 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
F13bQ07968 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
F13bQ07968 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
F13bQ07968 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
F13bQ07968 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
F13bQ07968 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
F13bQ07968 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
F13bQ07968 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
F13bQ07968 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
F13bQ07968 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
F13bQ07968 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
F13bQ07968 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
F13bQ07968 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
F13bQ07968 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
F13bQ07968 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
F13bQ07968 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
F13bQ07968 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
F13bQ07968 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
F13bQ07968 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
F13bQ07968 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
F13bQ07968 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
F13bQ07968 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
F13bQ07968 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
F13bQ07968 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
F13bQ07968 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
F13bQ07968 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
F13bQ07968 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms