Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Col9a2Q07643 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Col9a2Q07643 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Col9a2Q07643 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Col9a2Q07643 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Col9a2Q07643 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Col9a2Q07643 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Col9a2Q07643 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Col9a2Q07643 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Col9a2Q07643 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Col9a2Q07643 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Col9a2Q07643 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Col9a2Q07643 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Col9a2Q07643 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Col9a2Q07643 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Col9a2Q07643 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Col9a2Q07643 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Col9a2Q07643 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Col9a2Q07643 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Col9a2Q07643 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Col9a2Q07643 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Col9a2Q07643 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Col9a2Q07643 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Col9a2Q07643 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Col9a2Q07643 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Col9a2Q07643 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Col9a2Q07643 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Col9a2Q07643 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Col9a2Q07643 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Col9a2Q07643 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Col9a2Q07643 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Col9a2Q07643 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Col9a2Q07643 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Col9a2Q07643 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Col9a2Q07643 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Col9a2Q07643 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Col9a2Q07643 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Col9a2Q07643 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Col9a2Q07643 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Col9a2Q07643 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Col9a2Q07643 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Col9a2Q07643 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Col9a2Q07643 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Col9a2Q07643 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Col9a2Q07643 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col9a2Q07643 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col9a2Q07643 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Col9a2Q07643 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Col9a2Q07643 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Col9a2Q07643 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Col9a2Q07643 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Col9a2Q07643 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Col9a2Q07643 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col9a2Q07643 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col9a2Q07643 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col9a2Q07643 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col9a2Q07643 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Col9a2Q07643 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Col9a2Q07643 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Col9a2Q07643 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col9a2Q07643 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col9a2Q07643 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Col9a2Q07643 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Col9a2Q07643 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col9a2Q07643 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col9a2Q07643 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col9a2Q07643 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Col9a2Q07643 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col9a2Q07643 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Col9a2Q07643 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Col9a2Q07643 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Col9a2Q07643 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col9a2Q07643 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Col9a2Q07643 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Col9a2Q07643 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col9a2Q07643 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col9a2Q07643 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Col9a2Q07643 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col9a2Q07643 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Col9a2Q07643 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Col9a2Q07643 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Col9a2Q07643 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Col9a2Q07643 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Col9a2Q07643 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Col9a2Q07643 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col9a2Q07643 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Col9a2Q07643 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Col9a2Q07643 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Col9a2Q07643 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Col9a2Q07643 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Col9a2Q07643 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Col9a2Q07643 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Col9a2Q07643 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Col9a2Q07643 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Col9a2Q07643 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col9a2Q07643 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col9a2Q07643 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col9a2Q07643 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col9a2Q07643 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col9a2Q07643 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms