Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AmbpQ07456 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AmbpQ07456 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AmbpQ07456 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AmbpQ07456 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AmbpQ07456 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AmbpQ07456 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AmbpQ07456 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AmbpQ07456 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AmbpQ07456 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AmbpQ07456 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AmbpQ07456 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AmbpQ07456 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AmbpQ07456 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AmbpQ07456 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AmbpQ07456 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AmbpQ07456 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AmbpQ07456 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AmbpQ07456 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AmbpQ07456 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AmbpQ07456 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AmbpQ07456 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AmbpQ07456 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AmbpQ07456 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AmbpQ07456 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AmbpQ07456 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AmbpQ07456 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AmbpQ07456 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AmbpQ07456 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AmbpQ07456 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AmbpQ07456 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AmbpQ07456 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AmbpQ07456 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AmbpQ07456 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AmbpQ07456 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AmbpQ07456 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AmbpQ07456 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AmbpQ07456 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AmbpQ07456 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AmbpQ07456 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AmbpQ07456 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AmbpQ07456 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AmbpQ07456 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AmbpQ07456 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AmbpQ07456 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AmbpQ07456 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AmbpQ07456 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AmbpQ07456 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AmbpQ07456 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AmbpQ07456 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AmbpQ07456 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AmbpQ07456 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AmbpQ07456 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AmbpQ07456 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AmbpQ07456 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AmbpQ07456 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AmbpQ07456 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AmbpQ07456 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AmbpQ07456 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AmbpQ07456 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AmbpQ07456 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AmbpQ07456 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AmbpQ07456 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AmbpQ07456 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AmbpQ07456 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AmbpQ07456 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AmbpQ07456 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AmbpQ07456 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AmbpQ07456 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AmbpQ07456 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AmbpQ07456 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AmbpQ07456 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AmbpQ07456 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AmbpQ07456 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AmbpQ07456 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AmbpQ07456 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AmbpQ07456 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AmbpQ07456 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AmbpQ07456 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AmbpQ07456 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AmbpQ07456 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AmbpQ07456 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AmbpQ07456 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AmbpQ07456 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AmbpQ07456 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AmbpQ07456 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AmbpQ07456 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AmbpQ07456 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AmbpQ07456 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AmbpQ07456 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AmbpQ07456 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AmbpQ07456 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
AmbpQ07456 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AmbpQ07456 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AmbpQ07456 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AmbpQ07456 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AmbpQ07456 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AmbpQ07456 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AmbpQ07456 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AmbpQ07456 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms