Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r236Q05A06 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r236Q05A06 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r236Q05A06 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r236Q05A06 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r236Q05A06 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r236Q05A06 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r236Q05A06 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Vmn1r236Q05A06 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r236Q05A06 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r236Q05A06 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r236Q05A06 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r236Q05A06 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r236Q05A06 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r236Q05A06 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r236Q05A06 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r236Q05A06 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r236Q05A06 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r236Q05A06 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r236Q05A06 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r236Q05A06 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r236Q05A06 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r236Q05A06 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r236Q05A06 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r236Q05A06 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r236Q05A06 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r236Q05A06 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r236Q05A06 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r236Q05A06 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r236Q05A06 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r236Q05A06 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vmn1r236Q05A06 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r236Q05A06 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r236Q05A06 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r236Q05A06 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r236Q05A06 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r236Q05A06 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r236Q05A06 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r236Q05A06 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r236Q05A06 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r236Q05A06 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r236Q05A06 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r236Q05A06 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r236Q05A06 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r236Q05A06 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r236Q05A06 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r236Q05A06 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r236Q05A06 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r236Q05A06 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r236Q05A06 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r236Q05A06 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn1r236Q05A06 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Vmn1r236Q05A06 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn1r236Q05A06 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r236Q05A06 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r236Q05A06 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r236Q05A06 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r236Q05A06 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r236Q05A06 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r236Q05A06 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r236Q05A06 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r236Q05A06 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r236Q05A06 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r236Q05A06 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r236Q05A06 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r236Q05A06 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r236Q05A06 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r236Q05A06 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r236Q05A06 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vmn1r236Q05A06 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn1r236Q05A06 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r236Q05A06 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r236Q05A06 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r236Q05A06 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r236Q05A06 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r236Q05A06 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r236Q05A06 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r236Q05A06 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r236Q05A06 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r236Q05A06 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r236Q05A06 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r236Q05A06 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r236Q05A06 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r236Q05A06 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r236Q05A06 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r236Q05A06 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r236Q05A06 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r236Q05A06 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmn1r236Q05A06 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r236Q05A06 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r236Q05A06 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r236Q05A06 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r236Q05A06 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r236Q05A06 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r236Q05A06 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r236Q05A06 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r236Q05A06 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r236Q05A06 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r236Q05A06 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r236Q05A06 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms