Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nf1Q04690 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nf1Q04690 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Nf1Q04690 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nf1Q04690 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nf1Q04690 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nf1Q04690 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nf1Q04690 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nf1Q04690 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nf1Q04690 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nf1Q04690 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nf1Q04690 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nf1Q04690 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nf1Q04690 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nf1Q04690 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nf1Q04690 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nf1Q04690 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nf1Q04690 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nf1Q04690 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nf1Q04690 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nf1Q04690 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nf1Q04690 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nf1Q04690 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nf1Q04690 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nf1Q04690 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nf1Q04690 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nf1Q04690 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nf1Q04690 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nf1Q04690 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nf1Q04690 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nf1Q04690 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nf1Q04690 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nf1Q04690 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nf1Q04690 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nf1Q04690 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nf1Q04690 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nf1Q04690 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nf1Q04690 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nf1Q04690 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nf1Q04690 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nf1Q04690 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nf1Q04690 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nf1Q04690 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nf1Q04690 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nf1Q04690 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nf1Q04690 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nf1Q04690 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nf1Q04690 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nf1Q04690 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nf1Q04690 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nf1Q04690 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Nf1Q04690 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nf1Q04690 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nf1Q04690 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nf1Q04690 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nf1Q04690 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nf1Q04690 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nf1Q04690 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nf1Q04690 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nf1Q04690 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nf1Q04690 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nf1Q04690 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nf1Q04690 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nf1Q04690 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nf1Q04690 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nf1Q04690 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nf1Q04690 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nf1Q04690 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nf1Q04690 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nf1Q04690 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nf1Q04690 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nf1Q04690 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nf1Q04690 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nf1Q04690 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nf1Q04690 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nf1Q04690 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nf1Q04690 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nf1Q04690 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nf1Q04690 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nf1Q04690 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nf1Q04690 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nf1Q04690 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Nf1Q04690 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nf1Q04690 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nf1Q04690 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nf1Q04690 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nf1Q04690 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nf1Q04690 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nf1Q04690 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nf1Q04690 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nf1Q04690 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nf1Q04690 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nf1Q04690 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nf1Q04690 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Nf1Q04690 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nf1Q04690 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nf1Q04690 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nf1Q04690 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nf1Q04690 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nf1Q04690 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms