Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Scg2Q03517 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Scg2Q03517 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Scg2Q03517 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Scg2Q03517 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Scg2Q03517 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Scg2Q03517 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Scg2Q03517 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Scg2Q03517 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Scg2Q03517 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Scg2Q03517 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Scg2Q03517 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Scg2Q03517 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Scg2Q03517 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Scg2Q03517 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Scg2Q03517 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Scg2Q03517 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Scg2Q03517 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Scg2Q03517 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Scg2Q03517 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Scg2Q03517 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Scg2Q03517 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Scg2Q03517 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Scg2Q03517 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Scg2Q03517 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Scg2Q03517 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Scg2Q03517 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Scg2Q03517 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Scg2Q03517 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Scg2Q03517 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Scg2Q03517 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Scg2Q03517 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Scg2Q03517 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Scg2Q03517 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Scg2Q03517 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Scg2Q03517 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Scg2Q03517 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Scg2Q03517 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Scg2Q03517 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Scg2Q03517 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Scg2Q03517 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Scg2Q03517 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Scg2Q03517 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Scg2Q03517 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Scg2Q03517 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Scg2Q03517 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Scg2Q03517 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Scg2Q03517 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Scg2Q03517 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Scg2Q03517 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Scg2Q03517 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Scg2Q03517 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Scg2Q03517 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Scg2Q03517 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Scg2Q03517 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Scg2Q03517 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Scg2Q03517 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Scg2Q03517 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Scg2Q03517 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Scg2Q03517 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Scg2Q03517 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Scg2Q03517 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Scg2Q03517 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Scg2Q03517 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Scg2Q03517 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Scg2Q03517 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Scg2Q03517 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Scg2Q03517 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Scg2Q03517 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Scg2Q03517 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Scg2Q03517 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Scg2Q03517 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Scg2Q03517 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Scg2Q03517 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Scg2Q03517 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Scg2Q03517 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Scg2Q03517 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Scg2Q03517 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Scg2Q03517 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Scg2Q03517 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Scg2Q03517 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Scg2Q03517 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Scg2Q03517 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Scg2Q03517 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Scg2Q03517 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Scg2Q03517 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Scg2Q03517 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Scg2Q03517 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Scg2Q03517 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Scg2Q03517 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Scg2Q03517 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Scg2Q03517 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Scg2Q03517 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Scg2Q03517 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Scg2Q03517 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Scg2Q03517 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Scg2Q03517 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Scg2Q03517 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Scg2Q03517 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Scg2Q03517 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms