Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrcdQ00LT2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrcdQ00LT2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrcdQ00LT2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrcdQ00LT2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrcdQ00LT2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrcdQ00LT2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrcdQ00LT2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrcdQ00LT2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrcdQ00LT2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrcdQ00LT2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrcdQ00LT2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrcdQ00LT2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrcdQ00LT2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrcdQ00LT2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PrcdQ00LT2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrcdQ00LT2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PrcdQ00LT2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrcdQ00LT2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrcdQ00LT2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrcdQ00LT2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrcdQ00LT2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PrcdQ00LT2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrcdQ00LT2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrcdQ00LT2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrcdQ00LT2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrcdQ00LT2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrcdQ00LT2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrcdQ00LT2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrcdQ00LT2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrcdQ00LT2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrcdQ00LT2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrcdQ00LT2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrcdQ00LT2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrcdQ00LT2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrcdQ00LT2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PrcdQ00LT2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrcdQ00LT2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrcdQ00LT2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrcdQ00LT2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrcdQ00LT2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrcdQ00LT2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrcdQ00LT2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrcdQ00LT2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrcdQ00LT2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrcdQ00LT2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrcdQ00LT2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrcdQ00LT2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrcdQ00LT2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrcdQ00LT2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrcdQ00LT2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrcdQ00LT2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrcdQ00LT2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrcdQ00LT2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrcdQ00LT2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrcdQ00LT2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PrcdQ00LT2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrcdQ00LT2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrcdQ00LT2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrcdQ00LT2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrcdQ00LT2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrcdQ00LT2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrcdQ00LT2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrcdQ00LT2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrcdQ00LT2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrcdQ00LT2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrcdQ00LT2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrcdQ00LT2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrcdQ00LT2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrcdQ00LT2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrcdQ00LT2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrcdQ00LT2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrcdQ00LT2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PrcdQ00LT2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrcdQ00LT2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrcdQ00LT2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrcdQ00LT2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrcdQ00LT2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrcdQ00LT2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrcdQ00LT2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrcdQ00LT2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrcdQ00LT2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrcdQ00LT2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrcdQ00LT2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrcdQ00LT2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrcdQ00LT2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PrcdQ00LT2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrcdQ00LT2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrcdQ00LT2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrcdQ00LT2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PrcdQ00LT2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrcdQ00LT2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrcdQ00LT2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrcdQ00LT2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrcdQ00LT2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrcdQ00LT2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrcdQ00LT2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrcdQ00LT2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrcdQ00LT2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrcdQ00LT2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms