Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Itga4Q00651 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Itga4Q00651 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Itga4Q00651 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Itga4Q00651 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Itga4Q00651 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Itga4Q00651 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Itga4Q00651 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Itga4Q00651 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Itga4Q00651 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Itga4Q00651 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Itga4Q00651 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Itga4Q00651 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Itga4Q00651 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Itga4Q00651 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Itga4Q00651 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Itga4Q00651 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Itga4Q00651 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Itga4Q00651 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Itga4Q00651 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Itga4Q00651 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Itga4Q00651 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Itga4Q00651 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Itga4Q00651 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Itga4Q00651 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Itga4Q00651 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Itga4Q00651 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Itga4Q00651 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Itga4Q00651 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Itga4Q00651 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Itga4Q00651 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Itga4Q00651 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Itga4Q00651 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Itga4Q00651 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Itga4Q00651 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Itga4Q00651 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Itga4Q00651 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Itga4Q00651 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Itga4Q00651 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Itga4Q00651 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Itga4Q00651 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Itga4Q00651 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Itga4Q00651 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Itga4Q00651 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Itga4Q00651 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Itga4Q00651 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Itga4Q00651 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Itga4Q00651 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Itga4Q00651 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Itga4Q00651 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Itga4Q00651 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Itga4Q00651 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itga4Q00651 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Itga4Q00651 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Itga4Q00651 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Itga4Q00651 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Itga4Q00651 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Itga4Q00651 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Itga4Q00651 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Itga4Q00651 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Itga4Q00651 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Itga4Q00651 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Itga4Q00651 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Itga4Q00651 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Itga4Q00651 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Itga4Q00651 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Itga4Q00651 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Itga4Q00651 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Itga4Q00651 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Itga4Q00651 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Itga4Q00651 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Itga4Q00651 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Itga4Q00651 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Itga4Q00651 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Itga4Q00651 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Itga4Q00651 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Itga4Q00651 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Itga4Q00651 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Itga4Q00651 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Itga4Q00651 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Itga4Q00651 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Itga4Q00651 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Itga4Q00651 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Itga4Q00651 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Itga4Q00651 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Itga4Q00651 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Itga4Q00651 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Itga4Q00651 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Itga4Q00651 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Itga4Q00651 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Itga4Q00651 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Itga4Q00651 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Itga4Q00651 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Itga4Q00651 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itga4Q00651 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itga4Q00651 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itga4Q00651 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Itga4Q00651 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Itga4Q00651 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Itga4Q00651 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 445.4 ms