Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pax8Q00288 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pax8Q00288 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pax8Q00288 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pax8Q00288 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pax8Q00288 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pax8Q00288 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pax8Q00288 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Pax8Q00288 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pax8Q00288 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pax8Q00288 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pax8Q00288 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pax8Q00288 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pax8Q00288 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pax8Q00288 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pax8Q00288 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pax8Q00288 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pax8Q00288 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pax8Q00288 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pax8Q00288 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pax8Q00288 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pax8Q00288 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pax8Q00288 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pax8Q00288 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pax8Q00288 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pax8Q00288 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pax8Q00288 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pax8Q00288 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pax8Q00288 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pax8Q00288 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pax8Q00288 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pax8Q00288 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pax8Q00288 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pax8Q00288 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pax8Q00288 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pax8Q00288 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pax8Q00288 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pax8Q00288 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pax8Q00288 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pax8Q00288 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pax8Q00288 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pax8Q00288 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pax8Q00288 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pax8Q00288 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pax8Q00288 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pax8Q00288 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pax8Q00288 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pax8Q00288 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pax8Q00288 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pax8Q00288 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pax8Q00288 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pax8Q00288 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pax8Q00288 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pax8Q00288 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pax8Q00288 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pax8Q00288 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pax8Q00288 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pax8Q00288 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pax8Q00288 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pax8Q00288 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pax8Q00288 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pax8Q00288 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pax8Q00288 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pax8Q00288 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pax8Q00288 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pax8Q00288 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pax8Q00288 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pax8Q00288 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pax8Q00288 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pax8Q00288 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pax8Q00288 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pax8Q00288 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pax8Q00288 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pax8Q00288 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pax8Q00288 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pax8Q00288 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pax8Q00288 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pax8Q00288 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pax8Q00288 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pax8Q00288 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pax8Q00288 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pax8Q00288 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pax8Q00288 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pax8Q00288 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pax8Q00288 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pax8Q00288 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pax8Q00288 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pax8Q00288 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pax8Q00288 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pax8Q00288 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pax8Q00288 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pax8Q00288 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pax8Q00288 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pax8Q00288 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pax8Q00288 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pax8Q00288 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pax8Q00288 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Pax8Q00288 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pax8Q00288 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pax8Q00288 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms