Protein–RNA interactions for Protein: P97797

Sirpa, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SirpaP97797 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SirpaP97797 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SirpaP97797 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SirpaP97797 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SirpaP97797 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SirpaP97797 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SirpaP97797 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SirpaP97797 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SirpaP97797 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SirpaP97797 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SirpaP97797 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SirpaP97797 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SirpaP97797 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SirpaP97797 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SirpaP97797 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SirpaP97797 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SirpaP97797 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SirpaP97797 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SirpaP97797 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SirpaP97797 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SirpaP97797 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SirpaP97797 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SirpaP97797 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SirpaP97797 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SirpaP97797 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SirpaP97797 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SirpaP97797 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SirpaP97797 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SirpaP97797 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SirpaP97797 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SirpaP97797 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SirpaP97797 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SirpaP97797 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SirpaP97797 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SirpaP97797 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SirpaP97797 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SirpaP97797 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SirpaP97797 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SirpaP97797 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SirpaP97797 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SirpaP97797 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SirpaP97797 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SirpaP97797 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SirpaP97797 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SirpaP97797 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SirpaP97797 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SirpaP97797 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SirpaP97797 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SirpaP97797 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SirpaP97797 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SirpaP97797 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SirpaP97797 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SirpaP97797 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SirpaP97797 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SirpaP97797 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SirpaP97797 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SirpaP97797 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SirpaP97797 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SirpaP97797 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SirpaP97797 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SirpaP97797 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SirpaP97797 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SirpaP97797 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SirpaP97797 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SirpaP97797 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SirpaP97797 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SirpaP97797 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SirpaP97797 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SirpaP97797 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SirpaP97797 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SirpaP97797 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SirpaP97797 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SirpaP97797 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SirpaP97797 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SirpaP97797 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SirpaP97797 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SirpaP97797 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SirpaP97797 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SirpaP97797 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SirpaP97797 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SirpaP97797 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SirpaP97797 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SirpaP97797 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SirpaP97797 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SirpaP97797 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SirpaP97797 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SirpaP97797 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SirpaP97797 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SirpaP97797 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SirpaP97797 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SirpaP97797 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SirpaP97797 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SirpaP97797 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SirpaP97797 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SirpaP97797 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SirpaP97797 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SirpaP97797 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SirpaP97797 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SirpaP97797 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SirpaP97797 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms