Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pitx2P97474 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pitx2P97474 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pitx2P97474 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pitx2P97474 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pitx2P97474 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pitx2P97474 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pitx2P97474 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pitx2P97474 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pitx2P97474 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pitx2P97474 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pitx2P97474 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pitx2P97474 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pitx2P97474 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pitx2P97474 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pitx2P97474 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pitx2P97474 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pitx2P97474 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pitx2P97474 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pitx2P97474 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pitx2P97474 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pitx2P97474 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pitx2P97474 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pitx2P97474 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pitx2P97474 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pitx2P97474 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pitx2P97474 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pitx2P97474 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pitx2P97474 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pitx2P97474 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pitx2P97474 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pitx2P97474 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pitx2P97474 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pitx2P97474 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pitx2P97474 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pitx2P97474 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pitx2P97474 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pitx2P97474 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pitx2P97474 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pitx2P97474 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pitx2P97474 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pitx2P97474 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pitx2P97474 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pitx2P97474 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pitx2P97474 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pitx2P97474 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pitx2P97474 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pitx2P97474 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pitx2P97474 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pitx2P97474 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pitx2P97474 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pitx2P97474 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pitx2P97474 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pitx2P97474 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pitx2P97474 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pitx2P97474 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pitx2P97474 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pitx2P97474 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pitx2P97474 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pitx2P97474 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pitx2P97474 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pitx2P97474 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pitx2P97474 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pitx2P97474 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pitx2P97474 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pitx2P97474 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pitx2P97474 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pitx2P97474 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pitx2P97474 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pitx2P97474 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pitx2P97474 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pitx2P97474 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pitx2P97474 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pitx2P97474 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pitx2P97474 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pitx2P97474 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pitx2P97474 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pitx2P97474 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pitx2P97474 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pitx2P97474 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pitx2P97474 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pitx2P97474 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pitx2P97474 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pitx2P97474 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pitx2P97474 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pitx2P97474 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pitx2P97474 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pitx2P97474 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pitx2P97474 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pitx2P97474 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pitx2P97474 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pitx2P97474 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pitx2P97474 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pitx2P97474 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pitx2P97474 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pitx2P97474 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pitx2P97474 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pitx2P97474 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pitx2P97474 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pitx2P97474 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms