Protein–RNA interactions for Protein: P97454

Smad5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad5P97454 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smad5P97454 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smad5P97454 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smad5P97454 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smad5P97454 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smad5P97454 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smad5P97454 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smad5P97454 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smad5P97454 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smad5P97454 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smad5P97454 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smad5P97454 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smad5P97454 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smad5P97454 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smad5P97454 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smad5P97454 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smad5P97454 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smad5P97454 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smad5P97454 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smad5P97454 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smad5P97454 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smad5P97454 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smad5P97454 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Smad5P97454 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smad5P97454 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smad5P97454 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Smad5P97454 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smad5P97454 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Smad5P97454 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smad5P97454 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smad5P97454 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smad5P97454 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smad5P97454 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smad5P97454 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smad5P97454 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smad5P97454 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smad5P97454 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smad5P97454 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smad5P97454 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smad5P97454 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smad5P97454 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smad5P97454 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smad5P97454 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smad5P97454 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smad5P97454 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smad5P97454 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smad5P97454 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smad5P97454 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smad5P97454 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smad5P97454 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smad5P97454 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smad5P97454 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smad5P97454 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smad5P97454 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smad5P97454 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smad5P97454 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smad5P97454 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smad5P97454 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smad5P97454 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smad5P97454 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smad5P97454 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smad5P97454 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smad5P97454 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smad5P97454 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Smad5P97454 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smad5P97454 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smad5P97454 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smad5P97454 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smad5P97454 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smad5P97454 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smad5P97454 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smad5P97454 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Smad5P97454 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smad5P97454 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smad5P97454 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smad5P97454 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smad5P97454 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smad5P97454 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smad5P97454 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smad5P97454 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smad5P97454 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smad5P97454 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smad5P97454 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smad5P97454 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smad5P97454 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Smad5P97454 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smad5P97454 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smad5P97454 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smad5P97454 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Smad5P97454 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smad5P97454 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smad5P97454 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smad5P97454 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smad5P97454 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smad5P97454 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smad5P97454 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Smad5P97454 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smad5P97454 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smad5P97454 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smad5P97454 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms