Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gabpb2P81069 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gabpb2P81069 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Gabpb2P81069 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gabpb2P81069 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gabpb2P81069 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gabpb2P81069 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gabpb2P81069 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gabpb2P81069 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Gabpb2P81069 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gabpb2P81069 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gabpb2P81069 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gabpb2P81069 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gabpb2P81069 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gabpb2P81069 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gabpb2P81069 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Gabpb2P81069 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Gabpb2P81069 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gabpb2P81069 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gabpb2P81069 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gabpb2P81069 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gabpb2P81069 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gabpb2P81069 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gabpb2P81069 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Gabpb2P81069 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Gabpb2P81069 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gabpb2P81069 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gabpb2P81069 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gabpb2P81069 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gabpb2P81069 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gabpb2P81069 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gabpb2P81069 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gabpb2P81069 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gabpb2P81069 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gabpb2P81069 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gabpb2P81069 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gabpb2P81069 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gabpb2P81069 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gabpb2P81069 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gabpb2P81069 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gabpb2P81069 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gabpb2P81069 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gabpb2P81069 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gabpb2P81069 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gabpb2P81069 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gabpb2P81069 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gabpb2P81069 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gabpb2P81069 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gabpb2P81069 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gabpb2P81069 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gabpb2P81069 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gabpb2P81069 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gabpb2P81069 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gabpb2P81069 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gabpb2P81069 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gabpb2P81069 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gabpb2P81069 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gabpb2P81069 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gabpb2P81069 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gabpb2P81069 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gabpb2P81069 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gabpb2P81069 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gabpb2P81069 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gabpb2P81069 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gabpb2P81069 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gabpb2P81069 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Gabpb2P81069 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Gabpb2P81069 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gabpb2P81069 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gabpb2P81069 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gabpb2P81069 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gabpb2P81069 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gabpb2P81069 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gabpb2P81069 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gabpb2P81069 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Gabpb2P81069 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gabpb2P81069 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gabpb2P81069 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gabpb2P81069 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Gabpb2P81069 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gabpb2P81069 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Gabpb2P81069 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gabpb2P81069 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Gabpb2P81069 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gabpb2P81069 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Gabpb2P81069 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Gabpb2P81069 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gabpb2P81069 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gabpb2P81069 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gabpb2P81069 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gabpb2P81069 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gabpb2P81069 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gabpb2P81069 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gabpb2P81069 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gabpb2P81069 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gabpb2P81069 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gabpb2P81069 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gabpb2P81069 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gabpb2P81069 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gabpb2P81069 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms