Protein–RNA interactions for Protein: P70704

Atp8a1, Phospholipid-transporting ATPase IA, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8a1P70704 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp8a1P70704 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp8a1P70704 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp8a1P70704 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp8a1P70704 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp8a1P70704 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp8a1P70704 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp8a1P70704 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp8a1P70704 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atp8a1P70704 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atp8a1P70704 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atp8a1P70704 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp8a1P70704 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atp8a1P70704 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Atp8a1P70704 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atp8a1P70704 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atp8a1P70704 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atp8a1P70704 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atp8a1P70704 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atp8a1P70704 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atp8a1P70704 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atp8a1P70704 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp8a1P70704 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp8a1P70704 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atp8a1P70704 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atp8a1P70704 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atp8a1P70704 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atp8a1P70704 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atp8a1P70704 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atp8a1P70704 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atp8a1P70704 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atp8a1P70704 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp8a1P70704 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp8a1P70704 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp8a1P70704 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp8a1P70704 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp8a1P70704 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp8a1P70704 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp8a1P70704 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp8a1P70704 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atp8a1P70704 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atp8a1P70704 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atp8a1P70704 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp8a1P70704 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp8a1P70704 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp8a1P70704 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Atp8a1P70704 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Atp8a1P70704 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atp8a1P70704 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atp8a1P70704 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atp8a1P70704 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp8a1P70704 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp8a1P70704 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp8a1P70704 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp8a1P70704 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp8a1P70704 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp8a1P70704 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp8a1P70704 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp8a1P70704 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atp8a1P70704 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atp8a1P70704 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp8a1P70704 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp8a1P70704 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp8a1P70704 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp8a1P70704 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp8a1P70704 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp8a1P70704 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp8a1P70704 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp8a1P70704 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp8a1P70704 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp8a1P70704 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Atp8a1P70704 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp8a1P70704 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp8a1P70704 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp8a1P70704 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp8a1P70704 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp8a1P70704 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp8a1P70704 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp8a1P70704 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp8a1P70704 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp8a1P70704 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp8a1P70704 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp8a1P70704 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp8a1P70704 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp8a1P70704 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp8a1P70704 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Atp8a1P70704 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atp8a1P70704 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Atp8a1P70704 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp8a1P70704 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp8a1P70704 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp8a1P70704 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp8a1P70704 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp8a1P70704 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp8a1P70704 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp8a1P70704 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp8a1P70704 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp8a1P70704 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp8a1P70704 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atp8a1P70704 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms