Protein–RNA interactions for Protein: P70343

Casp4, Caspase-4, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp4P70343 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Casp4P70343 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Casp4P70343 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Casp4P70343 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Casp4P70343 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Casp4P70343 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Casp4P70343 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Casp4P70343 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Casp4P70343 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Casp4P70343 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Casp4P70343 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Casp4P70343 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Casp4P70343 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Casp4P70343 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Casp4P70343 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Casp4P70343 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Casp4P70343 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Casp4P70343 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Casp4P70343 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Casp4P70343 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Casp4P70343 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Casp4P70343 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Casp4P70343 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Casp4P70343 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Casp4P70343 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Casp4P70343 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Casp4P70343 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Casp4P70343 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Casp4P70343 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Casp4P70343 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Casp4P70343 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Casp4P70343 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Casp4P70343 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Casp4P70343 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Casp4P70343 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Casp4P70343 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Casp4P70343 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Casp4P70343 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Casp4P70343 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Casp4P70343 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Casp4P70343 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Casp4P70343 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Casp4P70343 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Casp4P70343 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Casp4P70343 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Casp4P70343 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Casp4P70343 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Casp4P70343 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Casp4P70343 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Casp4P70343 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Casp4P70343 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Casp4P70343 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Casp4P70343 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Casp4P70343 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Casp4P70343 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Casp4P70343 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Casp4P70343 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Casp4P70343 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Casp4P70343 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Casp4P70343 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Casp4P70343 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Casp4P70343 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Casp4P70343 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Casp4P70343 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Casp4P70343 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Casp4P70343 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Casp4P70343 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Casp4P70343 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Casp4P70343 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Casp4P70343 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Casp4P70343 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Casp4P70343 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Casp4P70343 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Casp4P70343 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Casp4P70343 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Casp4P70343 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Casp4P70343 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Casp4P70343 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Casp4P70343 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Casp4P70343 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Casp4P70343 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Casp4P70343 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Casp4P70343 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Casp4P70343 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Casp4P70343 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Casp4P70343 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Casp4P70343 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Casp4P70343 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Casp4P70343 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Casp4P70343 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Casp4P70343 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Casp4P70343 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Casp4P70343 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Casp4P70343 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Casp4P70343 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Casp4P70343 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Casp4P70343 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Casp4P70343 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Casp4P70343 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Casp4P70343 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms