Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tgif1P70284 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tgif1P70284 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tgif1P70284 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tgif1P70284 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tgif1P70284 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tgif1P70284 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tgif1P70284 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tgif1P70284 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tgif1P70284 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tgif1P70284 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tgif1P70284 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tgif1P70284 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tgif1P70284 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tgif1P70284 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tgif1P70284 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tgif1P70284 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tgif1P70284 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tgif1P70284 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tgif1P70284 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tgif1P70284 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tgif1P70284 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tgif1P70284 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tgif1P70284 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tgif1P70284 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tgif1P70284 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tgif1P70284 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tgif1P70284 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tgif1P70284 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tgif1P70284 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tgif1P70284 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tgif1P70284 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tgif1P70284 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tgif1P70284 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tgif1P70284 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tgif1P70284 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tgif1P70284 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tgif1P70284 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tgif1P70284 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tgif1P70284 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tgif1P70284 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tgif1P70284 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tgif1P70284 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tgif1P70284 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tgif1P70284 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tgif1P70284 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tgif1P70284 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tgif1P70284 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tgif1P70284 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tgif1P70284 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tgif1P70284 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tgif1P70284 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tgif1P70284 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tgif1P70284 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tgif1P70284 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tgif1P70284 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tgif1P70284 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tgif1P70284 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tgif1P70284 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tgif1P70284 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tgif1P70284 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tgif1P70284 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tgif1P70284 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tgif1P70284 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tgif1P70284 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tgif1P70284 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tgif1P70284 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tgif1P70284 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tgif1P70284 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tgif1P70284 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tgif1P70284 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tgif1P70284 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tgif1P70284 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tgif1P70284 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tgif1P70284 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tgif1P70284 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tgif1P70284 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tgif1P70284 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Tgif1P70284 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tgif1P70284 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tgif1P70284 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tgif1P70284 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tgif1P70284 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tgif1P70284 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tgif1P70284 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tgif1P70284 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tgif1P70284 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tgif1P70284 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tgif1P70284 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tgif1P70284 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tgif1P70284 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tgif1P70284 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tgif1P70284 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tgif1P70284 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tgif1P70284 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tgif1P70284 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tgif1P70284 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tgif1P70284 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tgif1P70284 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tgif1P70284 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms