Protein–RNA interactions for Protein: P70274

Selenop, Selenoprotein P, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenopP70274 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SelenopP70274 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SelenopP70274 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SelenopP70274 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SelenopP70274 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SelenopP70274 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SelenopP70274 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SelenopP70274 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SelenopP70274 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SelenopP70274 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SelenopP70274 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SelenopP70274 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SelenopP70274 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SelenopP70274 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SelenopP70274 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SelenopP70274 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SelenopP70274 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SelenopP70274 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SelenopP70274 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SelenopP70274 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SelenopP70274 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SelenopP70274 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SelenopP70274 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SelenopP70274 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SelenopP70274 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SelenopP70274 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SelenopP70274 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SelenopP70274 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SelenopP70274 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SelenopP70274 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SelenopP70274 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SelenopP70274 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SelenopP70274 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SelenopP70274 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SelenopP70274 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SelenopP70274 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SelenopP70274 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SelenopP70274 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SelenopP70274 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SelenopP70274 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SelenopP70274 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SelenopP70274 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SelenopP70274 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SelenopP70274 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SelenopP70274 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SelenopP70274 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SelenopP70274 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SelenopP70274 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SelenopP70274 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SelenopP70274 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SelenopP70274 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SelenopP70274 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SelenopP70274 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SelenopP70274 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SelenopP70274 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SelenopP70274 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SelenopP70274 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SelenopP70274 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SelenopP70274 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SelenopP70274 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SelenopP70274 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SelenopP70274 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SelenopP70274 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SelenopP70274 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SelenopP70274 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SelenopP70274 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SelenopP70274 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SelenopP70274 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SelenopP70274 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SelenopP70274 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SelenopP70274 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SelenopP70274 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SelenopP70274 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SelenopP70274 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SelenopP70274 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SelenopP70274 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SelenopP70274 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SelenopP70274 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SelenopP70274 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SelenopP70274 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SelenopP70274 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SelenopP70274 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SelenopP70274 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SelenopP70274 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SelenopP70274 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SelenopP70274 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SelenopP70274 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SelenopP70274 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SelenopP70274 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SelenopP70274 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SelenopP70274 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SelenopP70274 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SelenopP70274 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SelenopP70274 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SelenopP70274 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SelenopP70274 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SelenopP70274 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SelenopP70274 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SelenopP70274 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SelenopP70274 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms