Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pkn1P70268 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pkn1P70268 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pkn1P70268 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Pkn1P70268 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pkn1P70268 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pkn1P70268 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pkn1P70268 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pkn1P70268 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Pkn1P70268 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Pkn1P70268 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Pkn1P70268 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Pkn1P70268 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pkn1P70268 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Pkn1P70268 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Pkn1P70268 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pkn1P70268 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pkn1P70268 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pkn1P70268 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pkn1P70268 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pkn1P70268 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pkn1P70268 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pkn1P70268 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pkn1P70268 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pkn1P70268 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pkn1P70268 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pkn1P70268 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pkn1P70268 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pkn1P70268 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pkn1P70268 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pkn1P70268 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Pkn1P70268 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pkn1P70268 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pkn1P70268 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pkn1P70268 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pkn1P70268 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pkn1P70268 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pkn1P70268 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pkn1P70268 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pkn1P70268 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pkn1P70268 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Pkn1P70268 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pkn1P70268 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pkn1P70268 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pkn1P70268 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pkn1P70268 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pkn1P70268 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pkn1P70268 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pkn1P70268 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pkn1P70268 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pkn1P70268 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pkn1P70268 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pkn1P70268 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pkn1P70268 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pkn1P70268 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pkn1P70268 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Pkn1P70268 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pkn1P70268 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pkn1P70268 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Pkn1P70268 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Pkn1P70268 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pkn1P70268 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pkn1P70268 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Pkn1P70268 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pkn1P70268 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Pkn1P70268 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pkn1P70268 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pkn1P70268 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pkn1P70268 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pkn1P70268 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pkn1P70268 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pkn1P70268 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pkn1P70268 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pkn1P70268 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pkn1P70268 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pkn1P70268 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pkn1P70268 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pkn1P70268 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pkn1P70268 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pkn1P70268 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pkn1P70268 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pkn1P70268 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pkn1P70268 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pkn1P70268 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Pkn1P70268 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pkn1P70268 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pkn1P70268 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pkn1P70268 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pkn1P70268 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pkn1P70268 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pkn1P70268 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pkn1P70268 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Pkn1P70268 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pkn1P70268 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pkn1P70268 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Pkn1P70268 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pkn1P70268 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pkn1P70268 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pkn1P70268 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Pkn1P70268 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms