Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Traf5P70191 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Traf5P70191 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Traf5P70191 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Traf5P70191 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Traf5P70191 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Traf5P70191 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Traf5P70191 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Traf5P70191 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Traf5P70191 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Traf5P70191 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Traf5P70191 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Traf5P70191 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Traf5P70191 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Traf5P70191 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Traf5P70191 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Traf5P70191 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Traf5P70191 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Traf5P70191 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Traf5P70191 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Traf5P70191 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Traf5P70191 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Traf5P70191 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Traf5P70191 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Traf5P70191 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Traf5P70191 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Traf5P70191 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Traf5P70191 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Traf5P70191 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Traf5P70191 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Traf5P70191 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Traf5P70191 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Traf5P70191 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Traf5P70191 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Traf5P70191 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Traf5P70191 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Traf5P70191 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Traf5P70191 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Traf5P70191 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Traf5P70191 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Traf5P70191 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Traf5P70191 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Traf5P70191 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Traf5P70191 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Traf5P70191 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Traf5P70191 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Traf5P70191 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Traf5P70191 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Traf5P70191 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Traf5P70191 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Traf5P70191 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Traf5P70191 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Traf5P70191 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Traf5P70191 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Traf5P70191 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Traf5P70191 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Traf5P70191 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Traf5P70191 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Traf5P70191 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Traf5P70191 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Traf5P70191 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Traf5P70191 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Traf5P70191 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Traf5P70191 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Traf5P70191 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Traf5P70191 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Traf5P70191 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Traf5P70191 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Traf5P70191 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Traf5P70191 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Traf5P70191 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Traf5P70191 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Traf5P70191 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Traf5P70191 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Traf5P70191 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Traf5P70191 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Traf5P70191 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Traf5P70191 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Traf5P70191 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Traf5P70191 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Traf5P70191 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Traf5P70191 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Traf5P70191 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Traf5P70191 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Traf5P70191 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Traf5P70191 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Traf5P70191 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Traf5P70191 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Traf5P70191 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Traf5P70191 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Traf5P70191 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Traf5P70191 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Traf5P70191 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Traf5P70191 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Traf5P70191 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Traf5P70191 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Traf5P70191 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Traf5P70191 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Traf5P70191 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Traf5P70191 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms