Protein–RNA interactions for Protein: P68373

Tuba1c, Tubulin alpha-1C chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba1cP68373 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tuba1cP68373 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tuba1cP68373 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tuba1cP68373 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tuba1cP68373 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tuba1cP68373 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tuba1cP68373 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tuba1cP68373 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tuba1cP68373 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tuba1cP68373 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tuba1cP68373 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tuba1cP68373 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Tuba1cP68373 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tuba1cP68373 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tuba1cP68373 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tuba1cP68373 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tuba1cP68373 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tuba1cP68373 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tuba1cP68373 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tuba1cP68373 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tuba1cP68373 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tuba1cP68373 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tuba1cP68373 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tuba1cP68373 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tuba1cP68373 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tuba1cP68373 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tuba1cP68373 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tuba1cP68373 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tuba1cP68373 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tuba1cP68373 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tuba1cP68373 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tuba1cP68373 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tuba1cP68373 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tuba1cP68373 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tuba1cP68373 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tuba1cP68373 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tuba1cP68373 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tuba1cP68373 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tuba1cP68373 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tuba1cP68373 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tuba1cP68373 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tuba1cP68373 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tuba1cP68373 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tuba1cP68373 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tuba1cP68373 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tuba1cP68373 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tuba1cP68373 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tuba1cP68373 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tuba1cP68373 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tuba1cP68373 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tuba1cP68373 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tuba1cP68373 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tuba1cP68373 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tuba1cP68373 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tuba1cP68373 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tuba1cP68373 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tuba1cP68373 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tuba1cP68373 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tuba1cP68373 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tuba1cP68373 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tuba1cP68373 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tuba1cP68373 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tuba1cP68373 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tuba1cP68373 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tuba1cP68373 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tuba1cP68373 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tuba1cP68373 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tuba1cP68373 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tuba1cP68373 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tuba1cP68373 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tuba1cP68373 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tuba1cP68373 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tuba1cP68373 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tuba1cP68373 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tuba1cP68373 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tuba1cP68373 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tuba1cP68373 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tuba1cP68373 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tuba1cP68373 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tuba1cP68373 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tuba1cP68373 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tuba1cP68373 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tuba1cP68373 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tuba1cP68373 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tuba1cP68373 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tuba1cP68373 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tuba1cP68373 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tuba1cP68373 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tuba1cP68373 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tuba1cP68373 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tuba1cP68373 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tuba1cP68373 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tuba1cP68373 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tuba1cP68373 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tuba1cP68373 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tuba1cP68373 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tuba1cP68373 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tuba1cP68373 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tuba1cP68373 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tuba1cP68373 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms