Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Acta1P68134 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Acta1P68134 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Acta1P68134 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acta1P68134 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acta1P68134 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Acta1P68134 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Acta1P68134 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Acta1P68134 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acta1P68134 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acta1P68134 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acta1P68134 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acta1P68134 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acta1P68134 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acta1P68134 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Acta1P68134 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Acta1P68134 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acta1P68134 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acta1P68134 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Acta1P68134 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Acta1P68134 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Acta1P68134 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acta1P68134 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acta1P68134 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acta1P68134 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Acta1P68134 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Acta1P68134 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Acta1P68134 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Acta1P68134 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Acta1P68134 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Acta1P68134 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Acta1P68134 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Acta1P68134 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Acta1P68134 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acta1P68134 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acta1P68134 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Acta1P68134 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Acta1P68134 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Acta1P68134 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Acta1P68134 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Acta1P68134 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acta1P68134 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acta1P68134 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acta1P68134 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Acta1P68134 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acta1P68134 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Acta1P68134 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Acta1P68134 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Acta1P68134 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Acta1P68134 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acta1P68134 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acta1P68134 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acta1P68134 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acta1P68134 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acta1P68134 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Acta1P68134 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acta1P68134 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acta1P68134 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acta1P68134 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Acta1P68134 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Acta1P68134 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Acta1P68134 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acta1P68134 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acta1P68134 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acta1P68134 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Acta1P68134 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Acta1P68134 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Acta1P68134 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Acta1P68134 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Acta1P68134 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Acta1P68134 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Acta1P68134 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acta1P68134 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acta1P68134 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acta1P68134 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Acta1P68134 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Acta1P68134 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Acta1P68134 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Acta1P68134 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Acta1P68134 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Acta1P68134 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Acta1P68134 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Acta1P68134 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Acta1P68134 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Acta1P68134 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acta1P68134 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acta1P68134 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acta1P68134 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acta1P68134 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Acta1P68134 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Acta1P68134 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Acta1P68134 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Acta1P68134 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acta1P68134 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Acta1P68134 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acta1P68134 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acta1P68134 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acta1P68134 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acta1P68134 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acta1P68134 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms