Protein–RNA interactions for Protein: P68033

Actc1, Actin, alpha cardiac muscle 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actc1P68033 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Actc1P68033 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Actc1P68033 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Actc1P68033 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Actc1P68033 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Actc1P68033 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actc1P68033 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actc1P68033 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actc1P68033 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Actc1P68033 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Actc1P68033 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Actc1P68033 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Actc1P68033 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Actc1P68033 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Actc1P68033 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Actc1P68033 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Actc1P68033 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Actc1P68033 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Actc1P68033 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actc1P68033 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actc1P68033 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Actc1P68033 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Actc1P68033 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Actc1P68033 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Actc1P68033 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Actc1P68033 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Actc1P68033 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Actc1P68033 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Actc1P68033 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Actc1P68033 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actc1P68033 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actc1P68033 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actc1P68033 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actc1P68033 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Actc1P68033 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Actc1P68033 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Actc1P68033 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Actc1P68033 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Actc1P68033 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Actc1P68033 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Actc1P68033 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actc1P68033 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actc1P68033 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actc1P68033 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Actc1P68033 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actc1P68033 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Actc1P68033 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Actc1P68033 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Actc1P68033 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Actc1P68033 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actc1P68033 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actc1P68033 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actc1P68033 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actc1P68033 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actc1P68033 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Actc1P68033 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Actc1P68033 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Actc1P68033 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Actc1P68033 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actc1P68033 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actc1P68033 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Actc1P68033 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actc1P68033 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actc1P68033 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actc1P68033 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Actc1P68033 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Actc1P68033 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Actc1P68033 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actc1P68033 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actc1P68033 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actc1P68033 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actc1P68033 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actc1P68033 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actc1P68033 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actc1P68033 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Actc1P68033 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Actc1P68033 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Actc1P68033 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Actc1P68033 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Actc1P68033 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Actc1P68033 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Actc1P68033 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Actc1P68033 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Actc1P68033 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Actc1P68033 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actc1P68033 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actc1P68033 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actc1P68033 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actc1P68033 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Actc1P68033 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Actc1P68033 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actc1P68033 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actc1P68033 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actc1P68033 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Actc1P68033 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Actc1P68033 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actc1P68033 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actc1P68033 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actc1P68033 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actc1P68033 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms