Protein–RNA interactions for Protein: P63157

Barhl1, BarH-like 1 homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barhl1P63157 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Barhl1P63157 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Barhl1P63157 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Barhl1P63157 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Barhl1P63157 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Barhl1P63157 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Barhl1P63157 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Barhl1P63157 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Barhl1P63157 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Barhl1P63157 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Barhl1P63157 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Barhl1P63157 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Barhl1P63157 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Barhl1P63157 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Barhl1P63157 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Barhl1P63157 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Barhl1P63157 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Barhl1P63157 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Barhl1P63157 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Barhl1P63157 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Barhl1P63157 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Barhl1P63157 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Barhl1P63157 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Barhl1P63157 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Barhl1P63157 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Barhl1P63157 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Barhl1P63157 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Barhl1P63157 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Barhl1P63157 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Barhl1P63157 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Barhl1P63157 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Barhl1P63157 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Barhl1P63157 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Barhl1P63157 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Barhl1P63157 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Barhl1P63157 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Barhl1P63157 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Barhl1P63157 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Barhl1P63157 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Barhl1P63157 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Barhl1P63157 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Barhl1P63157 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Barhl1P63157 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Barhl1P63157 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Barhl1P63157 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Barhl1P63157 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Barhl1P63157 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Barhl1P63157 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Barhl1P63157 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Barhl1P63157 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Barhl1P63157 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Barhl1P63157 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Barhl1P63157 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Barhl1P63157 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Barhl1P63157 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Barhl1P63157 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Barhl1P63157 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Barhl1P63157 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Barhl1P63157 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Barhl1P63157 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Barhl1P63157 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Barhl1P63157 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Barhl1P63157 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Barhl1P63157 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Barhl1P63157 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Barhl1P63157 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Barhl1P63157 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Barhl1P63157 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Barhl1P63157 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Barhl1P63157 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Barhl1P63157 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Barhl1P63157 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Barhl1P63157 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Barhl1P63157 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Barhl1P63157 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Barhl1P63157 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Barhl1P63157 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Barhl1P63157 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Barhl1P63157 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Barhl1P63157 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Barhl1P63157 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Barhl1P63157 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Barhl1P63157 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Barhl1P63157 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Barhl1P63157 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Barhl1P63157 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Barhl1P63157 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Barhl1P63157 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Barhl1P63157 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Barhl1P63157 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Barhl1P63157 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Barhl1P63157 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Barhl1P63157 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Barhl1P63157 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Barhl1P63157 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Barhl1P63157 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Barhl1P63157 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Barhl1P63157 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Barhl1P63157 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Barhl1P63157 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms