Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps28P62858 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps28P62858 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps28P62858 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps28P62858 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps28P62858 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps28P62858 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps28P62858 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps28P62858 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps28P62858 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps28P62858 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps28P62858 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps28P62858 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps28P62858 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps28P62858 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps28P62858 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps28P62858 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps28P62858 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps28P62858 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps28P62858 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps28P62858 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps28P62858 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps28P62858 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps28P62858 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps28P62858 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps28P62858 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps28P62858 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps28P62858 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps28P62858 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps28P62858 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps28P62858 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps28P62858 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps28P62858 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps28P62858 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps28P62858 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps28P62858 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps28P62858 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps28P62858 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps28P62858 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps28P62858 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps28P62858 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps28P62858 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps28P62858 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps28P62858 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps28P62858 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps28P62858 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps28P62858 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps28P62858 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps28P62858 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps28P62858 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps28P62858 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps28P62858 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps28P62858 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps28P62858 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps28P62858 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps28P62858 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps28P62858 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps28P62858 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps28P62858 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps28P62858 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps28P62858 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps28P62858 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps28P62858 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps28P62858 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps28P62858 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps28P62858 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps28P62858 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps28P62858 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps28P62858 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps28P62858 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps28P62858 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps28P62858 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps28P62858 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rps28P62858 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps28P62858 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps28P62858 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps28P62858 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps28P62858 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rps28P62858 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps28P62858 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps28P62858 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps28P62858 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps28P62858 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps28P62858 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps28P62858 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps28P62858 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps28P62858 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps28P62858 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps28P62858 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps28P62858 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps28P62858 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps28P62858 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps28P62858 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps28P62858 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps28P62858 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps28P62858 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Rps28P62858 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rps28P62858 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rps28P62858 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rps28P62858 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms