Protein–RNA interactions for Protein: P62838

Ube2d2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2P62838 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2d2P62838 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2d2P62838 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2d2P62838 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2d2P62838 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2d2P62838 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2d2P62838 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2d2P62838 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2d2P62838 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2d2P62838 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ube2d2P62838 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2d2P62838 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2d2P62838 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2d2P62838 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2d2P62838 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2d2P62838 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2d2P62838 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2d2P62838 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2d2P62838 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2d2P62838 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2d2P62838 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2d2P62838 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2d2P62838 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2d2P62838 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2d2P62838 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2d2P62838 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2d2P62838 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2d2P62838 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2d2P62838 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2d2P62838 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2d2P62838 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2d2P62838 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2d2P62838 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2d2P62838 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2d2P62838 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2d2P62838 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2d2P62838 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2d2P62838 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2d2P62838 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2d2P62838 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2d2P62838 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2d2P62838 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2d2P62838 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2d2P62838 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2d2P62838 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2d2P62838 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2d2P62838 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2d2P62838 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2d2P62838 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2d2P62838 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2d2P62838 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2d2P62838 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2d2P62838 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2d2P62838 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2d2P62838 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2d2P62838 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2d2P62838 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2d2P62838 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2d2P62838 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2d2P62838 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Ube2d2P62838 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2d2P62838 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2d2P62838 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2d2P62838 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2d2P62838 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2d2P62838 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2d2P62838 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2d2P62838 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2d2P62838 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2d2P62838 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2d2P62838 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2d2P62838 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2d2P62838 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ube2d2P62838 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ube2d2P62838 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ube2d2P62838 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ube2d2P62838 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ube2d2P62838 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ube2d2P62838 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ube2d2P62838 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ube2d2P62838 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ube2d2P62838 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ube2d2P62838 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ube2d2P62838 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ube2d2P62838 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2d2P62838 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2d2P62838 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2d2P62838 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2d2P62838 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2d2P62838 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2d2P62838 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2d2P62838 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2d2P62838 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2d2P62838 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ube2d2P62838 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ube2d2P62838 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2d2P62838 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2d2P62838 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2d2P62838 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2d2P62838 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms