Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rpl23P62830 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rpl23P62830 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rpl23P62830 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpl23P62830 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpl23P62830 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpl23P62830 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpl23P62830 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpl23P62830 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpl23P62830 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpl23P62830 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpl23P62830 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpl23P62830 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rpl23P62830 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rpl23P62830 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpl23P62830 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpl23P62830 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpl23P62830 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpl23P62830 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpl23P62830 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpl23P62830 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpl23P62830 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpl23P62830 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpl23P62830 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpl23P62830 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpl23P62830 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpl23P62830 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpl23P62830 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpl23P62830 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpl23P62830 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpl23P62830 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpl23P62830 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpl23P62830 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpl23P62830 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpl23P62830 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpl23P62830 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl23P62830 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl23P62830 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpl23P62830 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpl23P62830 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpl23P62830 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpl23P62830 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpl23P62830 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rpl23P62830 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rpl23P62830 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rpl23P62830 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rpl23P62830 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rpl23P62830 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rpl23P62830 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rpl23P62830 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rpl23P62830 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rpl23P62830 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rpl23P62830 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rpl23P62830 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rpl23P62830 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rpl23P62830 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rpl23P62830 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rpl23P62830 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rpl23P62830 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rpl23P62830 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rpl23P62830 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpl23P62830 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpl23P62830 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpl23P62830 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpl23P62830 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpl23P62830 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpl23P62830 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpl23P62830 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpl23P62830 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpl23P62830 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rpl23P62830 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpl23P62830 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpl23P62830 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpl23P62830 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl23P62830 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl23P62830 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl23P62830 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl23P62830 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl23P62830 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl23P62830 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl23P62830 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl23P62830 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl23P62830 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl23P62830 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl23P62830 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl23P62830 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl23P62830 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rpl23P62830 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpl23P62830 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl23P62830 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl23P62830 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl23P62830 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl23P62830 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl23P62830 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl23P62830 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl23P62830 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl23P62830 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl23P62830 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl23P62830 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl23P62830 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms