Protein–RNA interactions for Protein: P61166

Tmem258, Transmembrane protein 258, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem258P61166 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem258P61166 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem258P61166 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem258P61166 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem258P61166 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem258P61166 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem258P61166 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem258P61166 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem258P61166 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem258P61166 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem258P61166 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem258P61166 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem258P61166 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem258P61166 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem258P61166 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem258P61166 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem258P61166 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem258P61166 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem258P61166 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem258P61166 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem258P61166 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem258P61166 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem258P61166 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem258P61166 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem258P61166 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem258P61166 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem258P61166 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem258P61166 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem258P61166 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem258P61166 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem258P61166 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem258P61166 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem258P61166 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem258P61166 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem258P61166 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem258P61166 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem258P61166 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem258P61166 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem258P61166 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem258P61166 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem258P61166 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem258P61166 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem258P61166 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem258P61166 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem258P61166 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem258P61166 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem258P61166 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem258P61166 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem258P61166 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem258P61166 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem258P61166 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem258P61166 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem258P61166 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem258P61166 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem258P61166 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem258P61166 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem258P61166 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem258P61166 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem258P61166 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem258P61166 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem258P61166 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem258P61166 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem258P61166 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem258P61166 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem258P61166 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem258P61166 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem258P61166 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem258P61166 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem258P61166 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem258P61166 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem258P61166 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem258P61166 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem258P61166 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem258P61166 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem258P61166 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem258P61166 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem258P61166 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem258P61166 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem258P61166 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem258P61166 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem258P61166 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem258P61166 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem258P61166 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem258P61166 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem258P61166 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem258P61166 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem258P61166 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem258P61166 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem258P61166 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem258P61166 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem258P61166 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem258P61166 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem258P61166 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem258P61166 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem258P61166 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem258P61166 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem258P61166 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem258P61166 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem258P61166 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem258P61166 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms