Protein–RNA interactions for Protein: P61082

Ube2m, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2mP61082 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube2mP61082 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube2mP61082 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube2mP61082 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube2mP61082 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube2mP61082 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube2mP61082 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Ube2mP61082 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2mP61082 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2mP61082 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2mP61082 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2mP61082 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2mP61082 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube2mP61082 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube2mP61082 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube2mP61082 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube2mP61082 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ube2mP61082 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ube2mP61082 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ube2mP61082 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ube2mP61082 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ube2mP61082 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ube2mP61082 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ube2mP61082 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube2mP61082 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube2mP61082 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ube2mP61082 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ube2mP61082 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ube2mP61082 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ube2mP61082 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ube2mP61082 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ube2mP61082 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ube2mP61082 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ube2mP61082 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ube2mP61082 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ube2mP61082 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ube2mP61082 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ube2mP61082 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ube2mP61082 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ube2mP61082 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ube2mP61082 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ube2mP61082 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ube2mP61082 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ube2mP61082 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube2mP61082 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube2mP61082 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube2mP61082 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube2mP61082 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ube2mP61082 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ube2mP61082 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ube2mP61082 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube2mP61082 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube2mP61082 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube2mP61082 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube2mP61082 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ube2mP61082 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ube2mP61082 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ube2mP61082 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ube2mP61082 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ube2mP61082 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube2mP61082 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube2mP61082 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube2mP61082 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ube2mP61082 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ube2mP61082 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube2mP61082 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ube2mP61082 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ube2mP61082 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ube2mP61082 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube2mP61082 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ube2mP61082 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ube2mP61082 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ube2mP61082 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ube2mP61082 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ube2mP61082 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ube2mP61082 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ube2mP61082 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ube2mP61082 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ube2mP61082 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ube2mP61082 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ube2mP61082 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ube2mP61082 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube2mP61082 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube2mP61082 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube2mP61082 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube2mP61082 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ube2mP61082 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ube2mP61082 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ube2mP61082 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ube2mP61082 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ube2mP61082 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ube2mP61082 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ube2mP61082 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ube2mP61082 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ube2mP61082 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ube2mP61082 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ube2mP61082 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ube2mP61082 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ube2mP61082 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ube2mP61082 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms