Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PlnP61014 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PlnP61014 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PlnP61014 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PlnP61014 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PlnP61014 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PlnP61014 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PlnP61014 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PlnP61014 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PlnP61014 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PlnP61014 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PlnP61014 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PlnP61014 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PlnP61014 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PlnP61014 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PlnP61014 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PlnP61014 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PlnP61014 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PlnP61014 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PlnP61014 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PlnP61014 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PlnP61014 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PlnP61014 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PlnP61014 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PlnP61014 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PlnP61014 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PlnP61014 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PlnP61014 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PlnP61014 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PlnP61014 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PlnP61014 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PlnP61014 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PlnP61014 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PlnP61014 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PlnP61014 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PlnP61014 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PlnP61014 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PlnP61014 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PlnP61014 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PlnP61014 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PlnP61014 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PlnP61014 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PlnP61014 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PlnP61014 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PlnP61014 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PlnP61014 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PlnP61014 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PlnP61014 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PlnP61014 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PlnP61014 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PlnP61014 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PlnP61014 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PlnP61014 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PlnP61014 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PlnP61014 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PlnP61014 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PlnP61014 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PlnP61014 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PlnP61014 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PlnP61014 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PlnP61014 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PlnP61014 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PlnP61014 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PlnP61014 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PlnP61014 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PlnP61014 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PlnP61014 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PlnP61014 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PlnP61014 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PlnP61014 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PlnP61014 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PlnP61014 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PlnP61014 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PlnP61014 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PlnP61014 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PlnP61014 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PlnP61014 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PlnP61014 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PlnP61014 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PlnP61014 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PlnP61014 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PlnP61014 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PlnP61014 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PlnP61014 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PlnP61014 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PlnP61014 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PlnP61014 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PlnP61014 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PlnP61014 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PlnP61014 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PlnP61014 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PlnP61014 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PlnP61014 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PlnP61014 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PlnP61014 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PlnP61014 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PlnP61014 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PlnP61014 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PlnP61014 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PlnP61014 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms