Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sem1P60897 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sem1P60897 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sem1P60897 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sem1P60897 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sem1P60897 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sem1P60897 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sem1P60897 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sem1P60897 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sem1P60897 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sem1P60897 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sem1P60897 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sem1P60897 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sem1P60897 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sem1P60897 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sem1P60897 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sem1P60897 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sem1P60897 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sem1P60897 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sem1P60897 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sem1P60897 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sem1P60897 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sem1P60897 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sem1P60897 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sem1P60897 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sem1P60897 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sem1P60897 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sem1P60897 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sem1P60897 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sem1P60897 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sem1P60897 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sem1P60897 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sem1P60897 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sem1P60897 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sem1P60897 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sem1P60897 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sem1P60897 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sem1P60897 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sem1P60897 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sem1P60897 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sem1P60897 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sem1P60897 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sem1P60897 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sem1P60897 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sem1P60897 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sem1P60897 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sem1P60897 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sem1P60897 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sem1P60897 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sem1P60897 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sem1P60897 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sem1P60897 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sem1P60897 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sem1P60897 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sem1P60897 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sem1P60897 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sem1P60897 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Sem1P60897 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Sem1P60897 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sem1P60897 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sem1P60897 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sem1P60897 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sem1P60897 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sem1P60897 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sem1P60897 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sem1P60897 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sem1P60897 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sem1P60897 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sem1P60897 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sem1P60897 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sem1P60897 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sem1P60897 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sem1P60897 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sem1P60897 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sem1P60897 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sem1P60897 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sem1P60897 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Sem1P60897 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sem1P60897 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sem1P60897 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sem1P60897 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sem1P60897 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sem1P60897 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sem1P60897 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sem1P60897 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sem1P60897 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sem1P60897 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sem1P60897 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sem1P60897 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sem1P60897 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sem1P60897 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sem1P60897 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sem1P60897 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sem1P60897 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sem1P60897 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sem1P60897 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sem1P60897 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sem1P60897 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sem1P60897 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sem1P60897 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms