Protein–RNA interactions for Protein: P59280

Klhl8, Kelch-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl8P59280 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl8P59280 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl8P59280 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl8P59280 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl8P59280 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl8P59280 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl8P59280 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl8P59280 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl8P59280 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl8P59280 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl8P59280 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl8P59280 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl8P59280 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl8P59280 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl8P59280 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl8P59280 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl8P59280 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl8P59280 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl8P59280 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl8P59280 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl8P59280 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl8P59280 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl8P59280 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl8P59280 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl8P59280 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl8P59280 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl8P59280 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl8P59280 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl8P59280 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl8P59280 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl8P59280 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhl8P59280 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhl8P59280 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhl8P59280 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl8P59280 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl8P59280 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhl8P59280 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhl8P59280 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhl8P59280 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhl8P59280 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl8P59280 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl8P59280 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl8P59280 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl8P59280 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl8P59280 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klhl8P59280 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klhl8P59280 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klhl8P59280 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Klhl8P59280 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Klhl8P59280 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl8P59280 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl8P59280 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl8P59280 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl8P59280 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhl8P59280 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhl8P59280 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl8P59280 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl8P59280 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl8P59280 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl8P59280 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl8P59280 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl8P59280 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl8P59280 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl8P59280 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl8P59280 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl8P59280 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl8P59280 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl8P59280 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl8P59280 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl8P59280 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl8P59280 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl8P59280 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl8P59280 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl8P59280 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl8P59280 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl8P59280 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl8P59280 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl8P59280 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl8P59280 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl8P59280 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl8P59280 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl8P59280 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl8P59280 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl8P59280 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Klhl8P59280 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Klhl8P59280 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klhl8P59280 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klhl8P59280 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl8P59280 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl8P59280 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl8P59280 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl8P59280 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl8P59280 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl8P59280 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl8P59280 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl8P59280 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl8P59280 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl8P59280 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl8P59280 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl8P59280 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms