Protein–RNA interactions for Protein: P59279

Rab2b, Ras-related protein Rab-2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2bP59279 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab2bP59279 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab2bP59279 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab2bP59279 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab2bP59279 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab2bP59279 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab2bP59279 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab2bP59279 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab2bP59279 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab2bP59279 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab2bP59279 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab2bP59279 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab2bP59279 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab2bP59279 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab2bP59279 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab2bP59279 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab2bP59279 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab2bP59279 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab2bP59279 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rab2bP59279 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab2bP59279 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab2bP59279 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab2bP59279 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab2bP59279 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab2bP59279 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab2bP59279 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab2bP59279 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab2bP59279 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab2bP59279 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab2bP59279 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab2bP59279 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab2bP59279 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab2bP59279 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab2bP59279 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab2bP59279 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab2bP59279 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab2bP59279 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab2bP59279 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab2bP59279 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rab2bP59279 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab2bP59279 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab2bP59279 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab2bP59279 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab2bP59279 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab2bP59279 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab2bP59279 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab2bP59279 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab2bP59279 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab2bP59279 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab2bP59279 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab2bP59279 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab2bP59279 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab2bP59279 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab2bP59279 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab2bP59279 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab2bP59279 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab2bP59279 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab2bP59279 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab2bP59279 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab2bP59279 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab2bP59279 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab2bP59279 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rab2bP59279 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab2bP59279 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab2bP59279 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab2bP59279 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab2bP59279 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab2bP59279 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab2bP59279 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab2bP59279 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab2bP59279 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab2bP59279 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab2bP59279 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab2bP59279 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab2bP59279 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab2bP59279 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab2bP59279 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab2bP59279 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab2bP59279 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab2bP59279 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab2bP59279 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab2bP59279 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab2bP59279 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab2bP59279 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab2bP59279 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab2bP59279 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab2bP59279 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab2bP59279 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab2bP59279 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab2bP59279 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab2bP59279 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rab2bP59279 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab2bP59279 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab2bP59279 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab2bP59279 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab2bP59279 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab2bP59279 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab2bP59279 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab2bP59279 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab2bP59279 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms