Protein–RNA interactions for Protein: P59114

Pcif1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcif1P59114 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pcif1P59114 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pcif1P59114 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pcif1P59114 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pcif1P59114 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pcif1P59114 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pcif1P59114 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pcif1P59114 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pcif1P59114 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Pcif1P59114 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pcif1P59114 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pcif1P59114 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pcif1P59114 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pcif1P59114 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pcif1P59114 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pcif1P59114 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pcif1P59114 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pcif1P59114 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pcif1P59114 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pcif1P59114 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pcif1P59114 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pcif1P59114 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pcif1P59114 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Pcif1P59114 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pcif1P59114 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pcif1P59114 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pcif1P59114 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pcif1P59114 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pcif1P59114 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pcif1P59114 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Pcif1P59114 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pcif1P59114 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pcif1P59114 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pcif1P59114 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pcif1P59114 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pcif1P59114 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pcif1P59114 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pcif1P59114 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pcif1P59114 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pcif1P59114 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pcif1P59114 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pcif1P59114 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pcif1P59114 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pcif1P59114 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pcif1P59114 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pcif1P59114 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pcif1P59114 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pcif1P59114 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pcif1P59114 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Pcif1P59114 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pcif1P59114 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pcif1P59114 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pcif1P59114 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Pcif1P59114 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pcif1P59114 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pcif1P59114 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pcif1P59114 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Pcif1P59114 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pcif1P59114 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pcif1P59114 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pcif1P59114 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pcif1P59114 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pcif1P59114 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pcif1P59114 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pcif1P59114 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pcif1P59114 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pcif1P59114 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pcif1P59114 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pcif1P59114 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pcif1P59114 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pcif1P59114 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Pcif1P59114 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pcif1P59114 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pcif1P59114 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pcif1P59114 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pcif1P59114 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pcif1P59114 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pcif1P59114 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pcif1P59114 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pcif1P59114 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pcif1P59114 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pcif1P59114 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pcif1P59114 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pcif1P59114 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pcif1P59114 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pcif1P59114 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pcif1P59114 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pcif1P59114 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pcif1P59114 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pcif1P59114 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pcif1P59114 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pcif1P59114 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pcif1P59114 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Pcif1P59114 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pcif1P59114 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pcif1P59114 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Pcif1P59114 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pcif1P59114 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pcif1P59114 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pcif1P59114 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms