Protein–RNA interactions for Protein: P59110

Senp1, Sentrin-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp1P59110 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Senp1P59110 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Senp1P59110 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Senp1P59110 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Senp1P59110 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Senp1P59110 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Senp1P59110 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Senp1P59110 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Senp1P59110 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Senp1P59110 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Senp1P59110 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Senp1P59110 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Senp1P59110 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Senp1P59110 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Senp1P59110 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Senp1P59110 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Senp1P59110 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Senp1P59110 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Senp1P59110 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Senp1P59110 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Senp1P59110 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Senp1P59110 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Senp1P59110 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Senp1P59110 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Senp1P59110 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Senp1P59110 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Senp1P59110 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Senp1P59110 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Senp1P59110 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Senp1P59110 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Senp1P59110 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Senp1P59110 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Senp1P59110 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Senp1P59110 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Senp1P59110 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Senp1P59110 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Senp1P59110 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Senp1P59110 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Senp1P59110 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Senp1P59110 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Senp1P59110 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Senp1P59110 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Senp1P59110 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Senp1P59110 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Senp1P59110 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Senp1P59110 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Senp1P59110 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Senp1P59110 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Senp1P59110 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Senp1P59110 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Senp1P59110 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Senp1P59110 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Senp1P59110 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Senp1P59110 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Senp1P59110 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Senp1P59110 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Senp1P59110 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Senp1P59110 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Senp1P59110 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Senp1P59110 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Senp1P59110 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Senp1P59110 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Senp1P59110 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Senp1P59110 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Senp1P59110 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Senp1P59110 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Senp1P59110 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Senp1P59110 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Senp1P59110 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Senp1P59110 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Senp1P59110 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Senp1P59110 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Senp1P59110 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Senp1P59110 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Senp1P59110 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Senp1P59110 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Senp1P59110 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Senp1P59110 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Senp1P59110 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Senp1P59110 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Senp1P59110 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Senp1P59110 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Senp1P59110 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Senp1P59110 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Senp1P59110 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Senp1P59110 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Senp1P59110 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Senp1P59110 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Senp1P59110 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Senp1P59110 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Senp1P59110 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Senp1P59110 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Senp1P59110 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Senp1P59110 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Senp1P59110 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Senp1P59110 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Senp1P59110 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Senp1P59110 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Senp1P59110 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Senp1P59110 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms