Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Csrnp3P59055 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Csrnp3P59055 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Csrnp3P59055 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Csrnp3P59055 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Csrnp3P59055 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Csrnp3P59055 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Csrnp3P59055 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Csrnp3P59055 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Csrnp3P59055 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Csrnp3P59055 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Csrnp3P59055 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Csrnp3P59055 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Csrnp3P59055 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Csrnp3P59055 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Csrnp3P59055 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Csrnp3P59055 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Csrnp3P59055 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Csrnp3P59055 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Csrnp3P59055 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Csrnp3P59055 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Csrnp3P59055 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Csrnp3P59055 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Csrnp3P59055 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Csrnp3P59055 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Csrnp3P59055 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Csrnp3P59055 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Csrnp3P59055 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Csrnp3P59055 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Csrnp3P59055 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Csrnp3P59055 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Csrnp3P59055 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Csrnp3P59055 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Csrnp3P59055 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Csrnp3P59055 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Csrnp3P59055 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Csrnp3P59055 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Csrnp3P59055 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Csrnp3P59055 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Csrnp3P59055 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Csrnp3P59055 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Csrnp3P59055 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Csrnp3P59055 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Csrnp3P59055 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Csrnp3P59055 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Csrnp3P59055 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Csrnp3P59055 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Csrnp3P59055 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Csrnp3P59055 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Csrnp3P59055 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Csrnp3P59055 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Csrnp3P59055 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Csrnp3P59055 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Csrnp3P59055 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Csrnp3P59055 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Csrnp3P59055 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Csrnp3P59055 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Csrnp3P59055 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Csrnp3P59055 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Csrnp3P59055 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Csrnp3P59055 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Csrnp3P59055 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Csrnp3P59055 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Csrnp3P59055 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Csrnp3P59055 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Csrnp3P59055 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Csrnp3P59055 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Csrnp3P59055 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Csrnp3P59055 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Csrnp3P59055 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Csrnp3P59055 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Csrnp3P59055 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Csrnp3P59055 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Csrnp3P59055 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Csrnp3P59055 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Csrnp3P59055 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Csrnp3P59055 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Csrnp3P59055 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Csrnp3P59055 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Csrnp3P59055 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Csrnp3P59055 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Csrnp3P59055 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Csrnp3P59055 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Csrnp3P59055 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Csrnp3P59055 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Csrnp3P59055 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Csrnp3P59055 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Csrnp3P59055 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Csrnp3P59055 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Csrnp3P59055 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Csrnp3P59055 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Csrnp3P59055 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Csrnp3P59055 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Csrnp3P59055 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Csrnp3P59055 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Csrnp3P59055 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Csrnp3P59055 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Csrnp3P59055 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Csrnp3P59055 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Csrnp3P59055 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms