Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Paxbp1P58501 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Paxbp1P58501 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Paxbp1P58501 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Paxbp1P58501 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Paxbp1P58501 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Paxbp1P58501 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Paxbp1P58501 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Paxbp1P58501 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Paxbp1P58501 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Paxbp1P58501 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Paxbp1P58501 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Paxbp1P58501 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Paxbp1P58501 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Paxbp1P58501 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Paxbp1P58501 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Paxbp1P58501 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Paxbp1P58501 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Paxbp1P58501 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Paxbp1P58501 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Paxbp1P58501 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Paxbp1P58501 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Paxbp1P58501 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Paxbp1P58501 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Paxbp1P58501 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Paxbp1P58501 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Paxbp1P58501 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Paxbp1P58501 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Paxbp1P58501 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Paxbp1P58501 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Paxbp1P58501 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Paxbp1P58501 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Paxbp1P58501 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Paxbp1P58501 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Paxbp1P58501 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Paxbp1P58501 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Paxbp1P58501 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Paxbp1P58501 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Paxbp1P58501 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Paxbp1P58501 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Paxbp1P58501 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Paxbp1P58501 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Paxbp1P58501 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Paxbp1P58501 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Paxbp1P58501 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Paxbp1P58501 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Paxbp1P58501 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Paxbp1P58501 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Paxbp1P58501 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Paxbp1P58501 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Paxbp1P58501 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Paxbp1P58501 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Paxbp1P58501 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Paxbp1P58501 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Paxbp1P58501 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Paxbp1P58501 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Paxbp1P58501 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Paxbp1P58501 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Paxbp1P58501 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Paxbp1P58501 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Paxbp1P58501 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Paxbp1P58501 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Paxbp1P58501 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Paxbp1P58501 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Paxbp1P58501 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Paxbp1P58501 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Paxbp1P58501 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Paxbp1P58501 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Paxbp1P58501 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Paxbp1P58501 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Paxbp1P58501 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Paxbp1P58501 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Paxbp1P58501 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Paxbp1P58501 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Paxbp1P58501 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Paxbp1P58501 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Paxbp1P58501 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Paxbp1P58501 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Paxbp1P58501 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Paxbp1P58501 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Paxbp1P58501 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Paxbp1P58501 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Paxbp1P58501 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Paxbp1P58501 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Paxbp1P58501 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Paxbp1P58501 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Paxbp1P58501 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Paxbp1P58501 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Paxbp1P58501 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Paxbp1P58501 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Paxbp1P58501 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Paxbp1P58501 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Paxbp1P58501 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Paxbp1P58501 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Paxbp1P58501 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Paxbp1P58501 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Paxbp1P58501 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Paxbp1P58501 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Paxbp1P58501 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Paxbp1P58501 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms