Protein–RNA interactions for Protein: P58391

Kcnn3, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn3P58391 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnn3P58391 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnn3P58391 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnn3P58391 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnn3P58391 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnn3P58391 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnn3P58391 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnn3P58391 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnn3P58391 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnn3P58391 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnn3P58391 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Kcnn3P58391 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnn3P58391 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnn3P58391 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnn3P58391 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnn3P58391 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnn3P58391 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnn3P58391 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnn3P58391 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnn3P58391 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnn3P58391 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnn3P58391 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcnn3P58391 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnn3P58391 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnn3P58391 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnn3P58391 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnn3P58391 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnn3P58391 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnn3P58391 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnn3P58391 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnn3P58391 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnn3P58391 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnn3P58391 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnn3P58391 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnn3P58391 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnn3P58391 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnn3P58391 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnn3P58391 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnn3P58391 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnn3P58391 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnn3P58391 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnn3P58391 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnn3P58391 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnn3P58391 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnn3P58391 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnn3P58391 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnn3P58391 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnn3P58391 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnn3P58391 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnn3P58391 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnn3P58391 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnn3P58391 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnn3P58391 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Kcnn3P58391 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnn3P58391 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnn3P58391 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnn3P58391 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnn3P58391 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnn3P58391 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnn3P58391 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnn3P58391 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnn3P58391 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnn3P58391 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnn3P58391 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnn3P58391 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnn3P58391 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnn3P58391 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnn3P58391 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnn3P58391 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnn3P58391 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kcnn3P58391 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kcnn3P58391 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnn3P58391 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnn3P58391 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnn3P58391 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnn3P58391 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnn3P58391 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnn3P58391 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnn3P58391 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnn3P58391 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnn3P58391 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnn3P58391 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnn3P58391 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnn3P58391 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnn3P58391 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnn3P58391 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnn3P58391 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnn3P58391 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnn3P58391 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnn3P58391 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnn3P58391 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnn3P58391 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnn3P58391 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnn3P58391 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnn3P58391 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnn3P58391 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnn3P58391 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnn3P58391 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnn3P58391 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnn3P58391 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms