Protein–RNA interactions for Protein: P54279

Pms2, Mismatch repair endonuclease PMS2, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms2P54279 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pms2P54279 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pms2P54279 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pms2P54279 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pms2P54279 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pms2P54279 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pms2P54279 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pms2P54279 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pms2P54279 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pms2P54279 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pms2P54279 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pms2P54279 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pms2P54279 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pms2P54279 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pms2P54279 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pms2P54279 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pms2P54279 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pms2P54279 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Pms2P54279 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pms2P54279 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Pms2P54279 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pms2P54279 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pms2P54279 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pms2P54279 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pms2P54279 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pms2P54279 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pms2P54279 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pms2P54279 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Pms2P54279 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pms2P54279 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pms2P54279 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pms2P54279 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pms2P54279 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pms2P54279 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pms2P54279 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pms2P54279 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pms2P54279 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pms2P54279 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pms2P54279 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pms2P54279 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pms2P54279 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pms2P54279 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pms2P54279 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pms2P54279 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pms2P54279 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Pms2P54279 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pms2P54279 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pms2P54279 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pms2P54279 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pms2P54279 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pms2P54279 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pms2P54279 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pms2P54279 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pms2P54279 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pms2P54279 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pms2P54279 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pms2P54279 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pms2P54279 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pms2P54279 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pms2P54279 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pms2P54279 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pms2P54279 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pms2P54279 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pms2P54279 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pms2P54279 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pms2P54279 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pms2P54279 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pms2P54279 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pms2P54279 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pms2P54279 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pms2P54279 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pms2P54279 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pms2P54279 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pms2P54279 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pms2P54279 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pms2P54279 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pms2P54279 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pms2P54279 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Pms2P54279 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pms2P54279 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pms2P54279 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pms2P54279 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pms2P54279 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pms2P54279 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pms2P54279 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pms2P54279 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pms2P54279 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pms2P54279 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pms2P54279 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pms2P54279 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pms2P54279 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Pms2P54279 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pms2P54279 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pms2P54279 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pms2P54279 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pms2P54279 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pms2P54279 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pms2P54279 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pms2P54279 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pms2P54279 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms