Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CnbpP53996 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CnbpP53996 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CnbpP53996 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CnbpP53996 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CnbpP53996 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CnbpP53996 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CnbpP53996 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CnbpP53996 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CnbpP53996 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CnbpP53996 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CnbpP53996 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CnbpP53996 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CnbpP53996 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CnbpP53996 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CnbpP53996 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CnbpP53996 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CnbpP53996 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CnbpP53996 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CnbpP53996 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CnbpP53996 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CnbpP53996 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CnbpP53996 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CnbpP53996 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CnbpP53996 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CnbpP53996 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CnbpP53996 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CnbpP53996 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CnbpP53996 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CnbpP53996 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CnbpP53996 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CnbpP53996 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CnbpP53996 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CnbpP53996 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CnbpP53996 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CnbpP53996 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CnbpP53996 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CnbpP53996 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CnbpP53996 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CnbpP53996 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CnbpP53996 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CnbpP53996 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CnbpP53996 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CnbpP53996 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CnbpP53996 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CnbpP53996 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CnbpP53996 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CnbpP53996 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CnbpP53996 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CnbpP53996 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CnbpP53996 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CnbpP53996 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CnbpP53996 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CnbpP53996 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CnbpP53996 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CnbpP53996 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CnbpP53996 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CnbpP53996 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CnbpP53996 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CnbpP53996 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CnbpP53996 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CnbpP53996 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CnbpP53996 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CnbpP53996 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CnbpP53996 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CnbpP53996 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CnbpP53996 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CnbpP53996 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CnbpP53996 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CnbpP53996 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CnbpP53996 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CnbpP53996 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CnbpP53996 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CnbpP53996 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CnbpP53996 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CnbpP53996 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CnbpP53996 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CnbpP53996 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CnbpP53996 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CnbpP53996 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CnbpP53996 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CnbpP53996 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CnbpP53996 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CnbpP53996 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CnbpP53996 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CnbpP53996 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CnbpP53996 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CnbpP53996 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CnbpP53996 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CnbpP53996 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CnbpP53996 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CnbpP53996 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CnbpP53996 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CnbpP53996 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CnbpP53996 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CnbpP53996 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CnbpP53996 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CnbpP53996 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CnbpP53996 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CnbpP53996 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms