Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PctpP53808 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PctpP53808 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PctpP53808 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PctpP53808 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PctpP53808 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PctpP53808 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PctpP53808 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PctpP53808 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PctpP53808 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PctpP53808 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PctpP53808 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PctpP53808 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PctpP53808 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PctpP53808 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PctpP53808 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PctpP53808 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PctpP53808 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PctpP53808 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PctpP53808 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PctpP53808 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PctpP53808 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PctpP53808 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PctpP53808 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PctpP53808 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PctpP53808 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PctpP53808 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PctpP53808 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PctpP53808 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PctpP53808 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PctpP53808 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PctpP53808 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PctpP53808 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PctpP53808 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PctpP53808 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PctpP53808 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PctpP53808 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PctpP53808 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PctpP53808 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PctpP53808 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PctpP53808 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PctpP53808 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PctpP53808 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PctpP53808 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PctpP53808 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PctpP53808 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PctpP53808 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PctpP53808 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PctpP53808 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PctpP53808 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PctpP53808 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PctpP53808 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PctpP53808 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PctpP53808 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PctpP53808 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PctpP53808 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PctpP53808 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PctpP53808 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PctpP53808 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PctpP53808 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PctpP53808 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PctpP53808 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PctpP53808 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PctpP53808 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PctpP53808 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PctpP53808 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PctpP53808 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PctpP53808 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PctpP53808 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PctpP53808 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PctpP53808 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PctpP53808 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PctpP53808 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PctpP53808 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PctpP53808 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PctpP53808 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PctpP53808 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PctpP53808 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PctpP53808 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PctpP53808 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PctpP53808 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PctpP53808 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PctpP53808 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PctpP53808 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PctpP53808 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PctpP53808 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PctpP53808 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PctpP53808 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PctpP53808 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PctpP53808 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PctpP53808 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PctpP53808 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PctpP53808 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PctpP53808 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PctpP53808 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PctpP53808 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PctpP53808 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PctpP53808 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PctpP53808 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PctpP53808 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms