Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Polr1cP52432 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Polr1cP52432 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Polr1cP52432 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Polr1cP52432 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Polr1cP52432 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Polr1cP52432 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Polr1cP52432 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr1cP52432 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr1cP52432 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr1cP52432 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Polr1cP52432 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr1cP52432 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr1cP52432 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr1cP52432 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr1cP52432 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr1cP52432 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Polr1cP52432 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr1cP52432 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr1cP52432 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr1cP52432 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Polr1cP52432 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Polr1cP52432 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Polr1cP52432 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Polr1cP52432 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Polr1cP52432 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Polr1cP52432 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Polr1cP52432 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Polr1cP52432 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Polr1cP52432 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Polr1cP52432 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Polr1cP52432 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr1cP52432 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr1cP52432 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Polr1cP52432 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Polr1cP52432 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Polr1cP52432 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr1cP52432 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Polr1cP52432 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr1cP52432 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr1cP52432 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr1cP52432 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr1cP52432 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr1cP52432 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr1cP52432 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Polr1cP52432 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Polr1cP52432 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Polr1cP52432 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Polr1cP52432 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Polr1cP52432 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Polr1cP52432 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr1cP52432 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr1cP52432 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr1cP52432 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr1cP52432 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr1cP52432 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr1cP52432 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr1cP52432 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr1cP52432 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr1cP52432 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr1cP52432 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr1cP52432 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr1cP52432 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr1cP52432 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr1cP52432 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr1cP52432 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr1cP52432 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr1cP52432 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr1cP52432 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr1cP52432 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr1cP52432 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr1cP52432 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr1cP52432 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr1cP52432 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr1cP52432 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr1cP52432 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr1cP52432 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr1cP52432 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr1cP52432 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr1cP52432 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr1cP52432 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr1cP52432 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr1cP52432 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr1cP52432 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr1cP52432 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr1cP52432 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr1cP52432 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr1cP52432 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr1cP52432 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr1cP52432 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr1cP52432 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr1cP52432 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr1cP52432 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr1cP52432 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr1cP52432 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Polr1cP52432 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr1cP52432 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr1cP52432 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr1cP52432 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr1cP52432 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms