Protein–RNA interactions for Protein: P52431

Pold1, DNA polymerase delta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold1P52431 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pold1P52431 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pold1P52431 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pold1P52431 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pold1P52431 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pold1P52431 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pold1P52431 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pold1P52431 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pold1P52431 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pold1P52431 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pold1P52431 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pold1P52431 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pold1P52431 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pold1P52431 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pold1P52431 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pold1P52431 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pold1P52431 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pold1P52431 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pold1P52431 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Pold1P52431 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pold1P52431 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pold1P52431 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pold1P52431 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pold1P52431 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pold1P52431 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pold1P52431 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pold1P52431 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pold1P52431 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pold1P52431 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pold1P52431 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pold1P52431 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pold1P52431 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Pold1P52431 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pold1P52431 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pold1P52431 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pold1P52431 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pold1P52431 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pold1P52431 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pold1P52431 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pold1P52431 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pold1P52431 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pold1P52431 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pold1P52431 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pold1P52431 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pold1P52431 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pold1P52431 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pold1P52431 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pold1P52431 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pold1P52431 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pold1P52431 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pold1P52431 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pold1P52431 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pold1P52431 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pold1P52431 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pold1P52431 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pold1P52431 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pold1P52431 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pold1P52431 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pold1P52431 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pold1P52431 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pold1P52431 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pold1P52431 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pold1P52431 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pold1P52431 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pold1P52431 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pold1P52431 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pold1P52431 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pold1P52431 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pold1P52431 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pold1P52431 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pold1P52431 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pold1P52431 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pold1P52431 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pold1P52431 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pold1P52431 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pold1P52431 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pold1P52431 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pold1P52431 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pold1P52431 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pold1P52431 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pold1P52431 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pold1P52431 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pold1P52431 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Pold1P52431 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pold1P52431 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pold1P52431 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pold1P52431 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pold1P52431 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pold1P52431 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pold1P52431 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pold1P52431 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pold1P52431 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pold1P52431 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pold1P52431 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pold1P52431 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pold1P52431 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pold1P52431 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pold1P52431 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pold1P52431 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pold1P52431 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms